November 2010 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Dimensions de la matrice MATRIX_CATCH_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_MET
by Bastien PREUSS Nov. 15, 2010

Nov. 15, 2010

Merci Eric, Le plan danalyse se lance mais sarrête après la première simu, et aucun fichier Historic.csv nest créé (malgré que le chemin soit bien spécifié dans le plan). Dautre part il semble y avoir contradiction sur les choix des sumOverDim de la matrice « ResultName. MATRIX_CATCH_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP », car dans le plan danalyse de la calibration les dimensions sont définies comme suit : L = L.sumOverDim(1);// sum over strategies L = L.sumOverDim(2);// sum over metiers L = L.sumOverDim(3);// sum over zones L = L.sumOverDim(4);// cumulated by groups Alors que dans le script ResultName, elles sont définies comme : /** * Matrix with five dimensions * Dimension 1 : Date * Dimension 2 : Strategy * Dimension 3 : Metier * Dimension 4 : Group * Dimension 5 : Zone */ Après plusieurs essais il semble que ça soit les dimensions spécifiées dans le ResultName qui soient les bonnes. Jobtiens cependant toujours lerreur : ERROR [pool-2-thread-4] (SimulationService.java:919) finished - Stop simulation plan, because can't call afterSimulation correctly on plan analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_BCO java.lang.IndexOutOfBoundsException: toIndex = 12 A quoi cela correspond il ? Bastien

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toujours le meme pb avec Caparmor....
by Stephanie MAHEVAS Nov. 15, 2010

Nov. 15, 2010

Bonjour cf objet. Je joins des extraits du debug. Ilne trouve pas le parameters.properties. Pourtant cette fois ci, pas de "+"... steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... INFO [monitor-thread] (SimulationStorage.java:463) getSimulation - Try to open simulation as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2789(F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2789) ERROR [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:420) run - An exception occurs durring monitoring fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible de lire les paramêtres du fichier : F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2789\parameters.properties at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:359) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.analyzeSensitivityResult(SimulationMonitor.java:658) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.doPostSimulationOperation(SimulationMonitor.java:619) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.waitAndCheckProgression(SimulationMonitor.java:474) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.run(SimulationMonitor.java:417) Caused by: java.io.FileNotFoundException: F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2789\parameters.properties (Le fichier spécifié est introuvable) at java.io.FileInputStream.open(Native Method) at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:353) ... 4 more INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:471) waitAndCheckProgression - Job as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804 finished INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:583) doPostSimulationOperation - Do post simulation operation for as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804 INFO [monitor-thread] (SimulationStorage.java:463) getSimulation - Try to open simulation as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804(F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804) ERROR [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:420) run - An exception occurs durring monitoring fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible de lire les paramêtres du fichier : F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804\parameters.properties at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:359) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.analyzeSensitivityResult(SimulationMonitor.java:658) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.doPostSimulationOperation(SimulationMonitor.java:619) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.waitAndCheckProgression(SimulationMonitor.java:474) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.run(SimulationMonitor.java:417) Caused by: java.io.FileNotFoundException: F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2804\parameters.properties (Le fichier spécifié est introuvable) at java.io.FileInputStream.open(Native Method) at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:353) ... 4 more INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:194) setText - Simulate one month INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:194) setText - Add economics results INFO [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:583) doPostSimulationOperation - Do post simulation operation for as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2927 INFO [monitor-thread] (SimulationStorage.java:463) getSimulation - Try to open simulation as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2927(F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2927) ERROR [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:420) run - An exception occurs durring monitoring fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible de lire les paramêtres du fichier : F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2927\parameters.properties at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:359) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.analyzeSensitivityResult(SimulationMonitor.java:658) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.doPostSimulationOperation(SimulationMonitor.java:619) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.waitAndCheckProgression(SimulationMonitor.java:474) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.run(SimulationMonitor.java:417) Caused by: java.io.FileNotFoundException: F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2927\parameters.properties (Le fichier spécifié est introuvable) at java.io.FileInputStream.open(Native Method) at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:353) ... 4 more INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:194) setText - Téléchargement des résultats INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:194) setText - Simulation terminée INFO [monitor-thread] (SimulationStorage.java:463) getSimulation - Try to open simulation as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2966(F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2966) ERROR [monitor-thread] (SimulationMonitor.java:420) run - An exception occurs durring monitoring fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Impossible de lire les paramêtres du fichier : F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2966\parameters.properties at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:359) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.analyzeSensitivityResult(SimulationMonitor.java:658) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.doPostSimulationOperation(SimulationMonitor.java:619) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.waitAndCheckProgression(SimulationMonitor.java:474) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationMonitor.run(SimulationMonitor.java:417) Caused by: java.io.FileNotFoundException: F:\stefisis\isis-database-3\simulations\as_ICES2010_Mplus_10Pourct_152Param_2010-11-09-11-04_2966\parameters.properties (Le fichier spécifié est introuvable) at java.io.FileInputStream.open(Native Method) at java.io.FileInputStream.<init>(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.getParameter(SimulationStorage.java:353) ... 4 more INFO [monitor-thread] (SimulationControl.java:194) setText - Téléchargement des résultats

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Re: [Isis-fish-users] Erreur lors de la calibration
by Eric Chatellier Nov. 15, 2010

Nov. 15, 2010

Le 15/11/2010 14:13, Bastien PREUSS a écrit : > > Bonjour, > > Je tente toujours de faire tourner une calibration, mais sans succès, > j’obtiens la même erreur depuis vendredi… > > Est-ce quelqu’un saurait interpréter le debug ? > > Il s’agit peut être de chemins d’accès à des fichiers, mais je n’ai pas trouvé > d’où cela provenait. > Ça se produit car un des paramètres du plan n'est pas défini (null). Apparemment, on peux ne pas définir certains paramètres sur les règles (optionnel), mais sur les plans, ca plante. C'est peut être un bug. -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Erreur lors de la calibration
by Bastien PREUSS Nov. 15, 2010

Nov. 15, 2010

Bonjour, Je tente toujours de faire tourner une calibration, mais sans succès, jobtiens la même erreur depuis vendredi Est-ce quelquun saurait interpréter le debug ? Il sagit peut être de chemins daccès à des fichiers, mais je nai pas trouvé doù cela provenait. Merci. Bastien

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Erreur au lancement de la calibration
by bastien.preuss＠ifremer.fr Nov. 12, 2010

Nov. 12, 2010

Bonjour, j'essaie de lancer une calibration de la capturabilité, mais une erreur apparait avant le lancement du plan de simulations. D'après ce que j'ai vu dans le debug la raison indiquée est: ERROR [AWT-EventQueue-0] (SimulationService.java:721) <init> - isisfish.error.evaluate.preplan.script org.apache.commons.beanutils.ConversionException: Can't convert 'null' to org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity Mais je ne vois pas concrètement çà quoi cela fait référence. Est-ce que quelqu'un voit de quoi il s'agit? Merci? Bastien

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caparmor
by Stephanie MAHEVAS Nov. 9, 2010

Nov. 9, 2010

hello Caparmor me pose encore quelque soucis. Sur 3000 simus relancées hier, une petite partie a tourné (cf dans le isis-temp sur caparmor) et une toute petite partie a été rappatriée (cf dans simulations en local). J'ai un message dans le debug pour la derniere simu me disant qu'il ne trouve pas le param.properties en local..... Merci de votre aide Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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reprise d'une ancienne AS
by Stephanie MAHEVAS Nov. 8, 2010

Nov. 8, 2010

bonjour je n'arrive pas relire une ancienne AS. Je n'ai pas de message d'erreur dans le debug... Voici la region et l'AS. comment sont rangées les Simu dans la liste deroulante? par ordre alphabetique, par date...??? merci de votre aide Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Erreur d'import
by Paul MARCHAL Nov. 8, 2010

Nov. 8, 2010

Bonjour, J'utilise actuellement la version 3.3.0.3 d'Isis-Fish, et je souhaiterai utiliser les données d'une base créée lors d'une version antérieure (3.1.3). L'import (avec la version 3.3.0.3) marche avec certaines régions mais pas avec celle dont j'ai besoin (CHANNEL). J'ai d'abord un message m'indiquant qu'une migration en version 3.3 est nécessaire, je réponds oui, et voici le message d'erreur que j'obtiens: Erreur Message: org.nuiton.topia.TopiaRuntimeException: Database migration not succesfully ended ! Level: SEVERE Stack Trace: Database migration not succesfully ended ! org.nuiton.topia.migration.TopiaMigrationServiceImpl.preInit(TopiaMigrationServiceImpl.java:200) org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl.preInitServices(TopiaContextImpl.java:221) org.nuiton.topia.framework.TopiaContextImpl.<init>(TopiaContextImpl.java:181) org.nuiton.topia.TopiaContextFactory.getContext(TopiaContextFactory.java:126) fr.ifremer.isisfish.datastore.DataStorage.getStorage(DataStorage.java:213) fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputAction.loadRegion(InputAction.java:372) fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputUI.loadRegion(InputUI.java:133) fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputUI$1.run(InputUI.java:121) java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(InvocationEvent.java:209) java.awt.EventQueue.dispatchEvent(EventQueue.java:597) java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(EventDispatchThread.java:273) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(EventDispatchThread.java:183) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(EventDispatchThread.java:173) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:168) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:160) java.awt.EventDispatchThread.run(EventDispatchThread.java:121) Je peux vous envoyer la base entière, mais le fichier est trop gros. Pouvez vous m'envoyer une adress ftp où je puisse la déposer? Merci d'avance pour votre aide Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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Calibration Capturabilité
by Bastien PREUSS Nov. 4, 2010

Nov. 4, 2010

Bonjour, Jai quelques petites questions concernant la calibration de la capturabilité ;-) Sachant que la méthode du simplexe est utilisée sur 2 valeurs seulement (q1 et q2), on ne peux donc avoir que 2 valeurs différentes de capturabilité dans tout le tableau des capturabilités (par classe et par saison), cest bien ça ? Les paramètres saisis dans linterface de la population ne sont donc-t-ils pas du tout utilisées lors des simulations du plan dexpérience ? Afin de tout de même faire apparaître une variation de la capturabilité entre les saisons, serait-il possible dintroduire un facteur constant ? Par exemple : Saison1 Saison2 Immatures q1 2*q1 Matures q2 2*q2 Merci. Bastien

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Les dernières simus de l'AS ne se terminent jamais
by Delphine Rocklin Nov. 2, 2010

Nov. 2, 2010

Bonjour ISIS, encore un petit souci J'ai lancé une AS (enfin plutôt j'ai re-lancé une AS°) de 243 simus sur caparmor.....et ISIS bloque tjrs sur les dernières simus...il y en a à peu près 200 qui ont fonctionné sans soucis, et les petites dernières, impossible ! Ca fait 5 jours que ça tourne ! ce qui je suppose est plus que suffisant pour 243 simus non ? Donc voilà. Si qqun peut m'éclairer.... Merci Delph

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