March 2011 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets]
by Bastien Preuss March 18, 2011

March 18, 2011

Donc d'après ce que je vois dans le code, le paramètre "intervalle d'activité" dans l'onglet type de navire n'est pas utilisé non plus, c'est bien ça ? -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : jeudi 17 mars 2011 19:06 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets] Salut Bastien C'est exact ! bien vu. Dans l'interface TypeDeMaree, on doit saisir 1. Durée en HEURE 2. Temps minimal entre deux voyages en HEURE Dans l'interface StrategieSaisieMois, il apparait un menu deroulant avec les differents types de marées définis par les deux parametres saisis dans l'interface TypeDeMaree transformés en JOUR si la durée est >=24Heure et en HEURE sinon. Si on regarde dans l'API à TRIPTYPE, les deux parametres sont en Time unit qui est en HOUR PER DAY. Ces deux parametres sont donc bien stockées en HEURE. A+ stephanie Bastien Preuss a écrit : > Merci pour ces éclaircissements. > > Une toute petite remarque au passage: dans l'interface StrategieSaisieMois > où l'on sélectionne le type de marée, celui-ci est renseigné par son nom et > deux paramètres affichés, mais qui ne sont pas toujours donnés en jours. Ces > paramètres ont été saisis en heures dans l'onglet type de marée et sont > indiqués ici en jours si le nombre saisi est un multiple de 24, mais dans le > cas contraire, ils sont indiqués en heures. > > A+ > > Bastien > > > -----Message d'origine----- > De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org > [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie > MAHEVAS > Envoyé : mardi 15 mars 2011 20:37 > À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > Objet : Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de > trajets] > > Bonjour > > Je suis d'accord avec le brouillard autour des parametres inutiles (par > défaut) et des unités. > Il me semblait que l'on avait fait ce qu'il fallait pour les unités mais > il y a sûrement encore des faiblesses. > Pour ce qui est du temps minimal entre deux voyages : IL FAUT BIEN LE > SAISIR EN HEURES. > ISIS fait la conversion tout seul. On peut le voir dans l'interface > StrategieSaisieMois ou on selectionne le type de marée. Le type est > renseigné par son nom et deux parametres( duree en jour et tempsmin en > jour). > Le calcul du NbTrip est aussi fait automatiquement à la saisie et cette > equation n'est pas visible à l'utilisateir ni modifiable. Je sais plus > comment y acceder. Eric? > > > Pour ce qui est des parametres inutilisés par défaut, il faut voir ca > comme une souplesse car une fois saisis, il sont accessibles pour écrire > des scripts et peuvent être des variables utiles pour la dynamique. > Neanmoins on pourrait les différencier des autres avec une couleur > différente dans les interfaces. > Jean ou Youen n'avait-on pas deja fait une liste de ces parametres? > Les autre utilisateurs, si vous en avez identifié, merci de me les > renvoyer et je finaliserai une liste. > > a+ > stephanie > > Bastien Preuss a écrit : > >> Je pense que oui il faut le modifier, le plus simple est peut être de >> faire un report de bug aux lutins. >> >> Jenvoie ça demain après que Stéphanie et dautres aient pu faire leurs. >> >> Bastien >> >> *De :* isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org >> [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] *De la part de* >> Dominique PELLETIER >> *Envoyé :* mardi 15 mars 2011 15:27 >> *À :* isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >> *Objet :* Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre >> de trajets] >> >> Merci Bastien, >> >> dans ce cas, il faut savoir si on modifie dans le code puisque c'était >> prévu d'avoir un min de temps entre deux sorties >> Dominique >> >> Bastien Preuss a écrit : >> >> Pas évident de ne pas sembrouiller 1) entre ce qui est comptabilisé >> en jours et ce qui est comptabilisé en heures et 2) entre les >> paramètres utilisés dans les équations et ceux qui ne le sont pas (on >> ne voit pas la différence lors de la saisie). Par exemple dans le >> manuel utilisateur le temps minimal entre deux trajets est indiqué en >> jours, mais cest bien en heures quil faut le mettre daprès les >> équations. >> >> Donc de ce coté, cest bon pour Jessica qui a donné une durée de 16h. >> Mais effectivement ce temps minimum entre les trajets ne semble pas >> être pris en compte dans les équations, on le constate très bien en >> modifiant la valeur du temps minimal entre deux trajets qui ne modifie >> pas le nombre de trajets. >> >> Du coup léquation est plutôt : >> >> (Durationmonth-MinNbInactDaysst,t)*24 / TripDuration(str,t) >> >> Durationmonth et MinNbInactDaysst,t sont en jours et >> TripDurationstr,test en heures. >> >> Bastien >> >> *De :* Dominique PELLETIER [mailto:Dominique.Pelletier@ifremer.fr] >> *Envoyé :* mardi 15 mars 2011 13:44 >> *À :* PREUSS >> *Objet :* [Fwd: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de >> trajets] >> >> salut Bastien, >> >> tu as aussi été confronté à ce problème ? >> Domi >> >> >> -------- Message original -------- >> >> *Sujet: * >> >> >> >> [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets >> >> *Date: * >> >> >> >> Mon, 14 Mar 2011 23:04:13 +0000 >> >> *De: * >> >> >> >> Jessica Andre <Jessica.Andre(a)utas.edu.au> >> <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> >> >> *Répondre à :: * >> >> >> >> isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >> <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> >> >> *Pour :: * >> >> >> >> isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >> <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> >> <isis-fish-users(a)list.isis-fish.org> >> <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> >> >> >> >> >> >> Bonjour, >> >> Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les >> stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. >> >> Daprès larticle Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est >> défini comme : >> >> (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / >> (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) >> >> Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h >> >> Comme jai défini un metier inactivité dans mes stratégies, jai >> fixé MinNbInactDays à 0. >> >> Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour lavoir en >> heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca >> maffiche 93 trajets, cest-a-dire que ISIS ne prends pas en compte le >> MinTimeBetweenTrips >> >> Pourquoi ?! Je narrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS >> fait ce calcul... >> >> Merci davance. >> >> Jess >> >> >> > **************************************************************************** > *********** > >> *Dr Jessica André* >> >> Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) >> >> Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) >> >> Marine Research Laboratories, Private Bag 49 >> >> Hobart, TAS 7001, Australia >> >> Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 >> >> Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 >> >> Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> >> >> Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 >> >> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> >> >> -- >> >> >> Dominique PELLETIER >> >> Cadre de recherche Biodiversité >> >> Coordinatrice du projet PAMPA >> >> /Senior scientist/ >> >> /Head of PAMPA project/ >> >> http://wwz.ifremer.fr/pampa/ >> >> IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex >> >> Nouvelle-Calédonie >> >> Tél. (687) 285171 >> >> Fax. (687) 287857 >> >> -- >> >> Dominique PELLETIER >> >> Cadre de recherche Biodiversité >> >> Coordinatrice du projet PAMPA >> >> /Senior scientist/ >> >> /Head of PAMPA project/ >> >> http://wwz.ifremer.fr/pampa/ >> >> IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex >> >> Nouvelle-Calédonie >> >> Tél. (687) 285171 >> >> Fax. (687) 287857 >> >> ------------------------------------------------------------------------ >> >> _______________________________________________ >> Isis-fish-users mailing list >> Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >> http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users >> >> > > -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Impossible de coller/importer matrice changement de groupes
by Jessica Andre March 18, 2011

March 18, 2011

Bonjour, Y-a-t-il une raison particulière pour laquelle je ne peux pas importer d'un .csv ou coller les valeurs dans l'interface pour les matrice de changement de groupe d'une population en longueur?! A la main, c'est moins marrant, surtout quand la matrice est grande... Merci d'avance Jess *************************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow Wild Fisheries Program-Fisheries Aquaculture & Coasts (FAC) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º>

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Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets]
by Bastien Preuss March 17, 2011

March 17, 2011

Merci pour ces éclaircissements. Une toute petite remarque au passage: dans l'interface StrategieSaisieMois où l'on sélectionne le type de marée, celui-ci est renseigné par son nom et deux paramètres affichés, mais qui ne sont pas toujours donnés en jours. Ces paramètres ont été saisis en heures dans l'onglet type de marée et sont indiqués ici en jours si le nombre saisi est un multiple de 24, mais dans le cas contraire, ils sont indiqués en heures. A+ Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : mardi 15 mars 2011 20:37 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets] Bonjour Je suis d'accord avec le brouillard autour des parametres inutiles (par défaut) et des unités. Il me semblait que l'on avait fait ce qu'il fallait pour les unités mais il y a sûrement encore des faiblesses. Pour ce qui est du temps minimal entre deux voyages : IL FAUT BIEN LE SAISIR EN HEURES. ISIS fait la conversion tout seul. On peut le voir dans l'interface StrategieSaisieMois ou on selectionne le type de marée. Le type est renseigné par son nom et deux parametres( duree en jour et tempsmin en jour). Le calcul du NbTrip est aussi fait automatiquement à la saisie et cette equation n'est pas visible à l'utilisateir ni modifiable. Je sais plus comment y acceder. Eric? Pour ce qui est des parametres inutilisés par défaut, il faut voir ca comme une souplesse car une fois saisis, il sont accessibles pour écrire des scripts et peuvent être des variables utiles pour la dynamique. Neanmoins on pourrait les différencier des autres avec une couleur différente dans les interfaces. Jean ou Youen n'avait-on pas deja fait une liste de ces parametres? Les autre utilisateurs, si vous en avez identifié, merci de me les renvoyer et je finaliserai une liste. a+ stephanie Bastien Preuss a écrit : > > Je pense que oui il faut le modifier, le plus simple est peut être de > faire un report de bug aux lutins. > > Jenvoie ça demain après que Stéphanie et dautres aient pu faire leurs. > > Bastien > > *De :* isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org > [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] *De la part de* > Dominique PELLETIER > *Envoyé :* mardi 15 mars 2011 15:27 > *À :* isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > *Objet :* Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre > de trajets] > > Merci Bastien, > > dans ce cas, il faut savoir si on modifie dans le code puisque c'était > prévu d'avoir un min de temps entre deux sorties > Dominique > > Bastien Preuss a écrit : > > Pas évident de ne pas sembrouiller 1) entre ce qui est comptabilisé > en jours et ce qui est comptabilisé en heures et 2) entre les > paramètres utilisés dans les équations et ceux qui ne le sont pas (on > ne voit pas la différence lors de la saisie). Par exemple dans le > manuel utilisateur le temps minimal entre deux trajets est indiqué en > jours, mais cest bien en heures quil faut le mettre daprès les > équations. > > Donc de ce coté, cest bon pour Jessica qui a donné une durée de 16h. > Mais effectivement ce temps minimum entre les trajets ne semble pas > être pris en compte dans les équations, on le constate très bien en > modifiant la valeur du temps minimal entre deux trajets qui ne modifie > pas le nombre de trajets. > > Du coup léquation est plutôt : > > (Durationmonth-MinNbInactDaysst,t)*24 / TripDuration(str,t) > > Durationmonth et MinNbInactDaysst,t sont en jours et > TripDurationstr,test en heures. > > Bastien > > *De :* Dominique PELLETIER [mailto:Dominique.Pelletier@ifremer.fr] > *Envoyé :* mardi 15 mars 2011 13:44 > *À :* PREUSS > *Objet :* [Fwd: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de > trajets] > > salut Bastien, > > tu as aussi été confronté à ce problème ? > Domi > > > -------- Message original -------- > > *Sujet: * > > > > [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets > > *Date: * > > > > Mon, 14 Mar 2011 23:04:13 +0000 > > *De: * > > > > Jessica Andre <Jessica.Andre(a)utas.edu.au> > <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> > > *Répondre à :: * > > > > isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > > *Pour :: * > > > > isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > <isis-fish-users(a)list.isis-fish.org> > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > > > > > > Bonjour, > > Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les > stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. > > Daprès larticle Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est > défini comme : > > (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / > (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) > > Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h > > Comme jai défini un metier inactivité dans mes stratégies, jai > fixé MinNbInactDays à 0. > > Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour lavoir en > heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca > maffiche 93 trajets, cest-a-dire que ISIS ne prends pas en compte le > MinTimeBetweenTrips > > Pourquoi ?! Je narrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS > fait ce calcul... > > Merci davance. > > Jess > > **************************************************************************** *********** > > *Dr Jessica André* > > Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) > > Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) > > Marine Research Laboratories, Private Bag 49 > > Hobart, TAS 7001, Australia > > Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 > > Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 > > Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> > > Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 > > `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> > > -- > > > Dominique PELLETIER > > Cadre de recherche Biodiversité > > Coordinatrice du projet PAMPA > > /Senior scientist/ > > /Head of PAMPA project/ > > http://wwz.ifremer.fr/pampa/ > > IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex > > Nouvelle-Calédonie > > Tél. (687) 285171 > > Fax. (687) 287857 > > -- > > Dominique PELLETIER > > Cadre de recherche Biodiversité > > Coordinatrice du projet PAMPA > > /Senior scientist/ > > /Head of PAMPA project/ > > http://wwz.ifremer.fr/pampa/ > > IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex > > Nouvelle-Calédonie > > Tél. (687) 285171 > > Fax. (687) 287857 > > ------------------------------------------------------------------------ > > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users > -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets]
by Bastien Preuss March 15, 2011

March 15, 2011

Je pense que oui il faut le modifier, le plus simple est peut être de faire un report de bug aux lutins. Jenvoie ça demain après que Stéphanie et dautres aient pu faire leurs. Bastien De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Dominique PELLETIER Envoyé : mardi 15 mars 2011 15:27 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets] Merci Bastien, dans ce cas, il faut savoir si on modifie dans le code puisque c'était prévu d'avoir un min de temps entre deux sorties Dominique Bastien Preuss a écrit : Pas évident de ne pas sembrouiller 1) entre ce qui est comptabilisé en jours et ce qui est comptabilisé en heures et 2) entre les paramètres utilisés dans les équations et ceux qui ne le sont pas (on ne voit pas la différence lors de la saisie). Par exemple dans le manuel utilisateur le temps minimal entre deux trajets est indiqué en jours, mais cest bien en heures quil faut le mettre daprès les équations. Donc de ce coté, cest bon pour Jessica qui a donné une durée de 16h. Mais effectivement ce temps minimum entre les trajets ne semble pas être pris en compte dans les équations, on le constate très bien en modifiant la valeur du temps minimal entre deux trajets qui ne modifie pas le nombre de trajets. Du coup léquation est plutôt : (Durationmonth-MinNbInactDaysst,t)*24 / TripDuration(str,t) Durationmonth et MinNbInactDaysst,t sont en jours et TripDurationstr,test en heures. Bastien De : Dominique PELLETIER [mailto:Dominique.Pelletier@ifremer.fr] Envoyé : mardi 15 mars 2011 13:44 À : PREUSS Objet : [Fwd: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets] salut Bastien, tu as aussi été confronté à ce problème ? Domi -------- Message original -------- Sujet: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets Date: Mon, 14 Mar 2011 23:04:13 +0000 De: Jessica Andre <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> <Jessica.Andre(a)utas.edu.au> Répondre à :: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Pour :: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> <isis-fish-users(a)list.isis-fish.org> Bonjour, Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. Daprès larticle Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est défini comme : (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h Comme jai défini un metier inactivité dans mes stratégies, jai fixé MinNbInactDays à 0. Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour lavoir en heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca maffiche 93 trajets, cest-a-dire que ISIS ne prends pas en compte le MinTimeBetweenTrips Pourquoi ?! Je narrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS fait ce calcul... Merci davance. Jess **************************************************************************** *********** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> -- Dominique PELLETIER Cadre de recherche Biodiversité Coordinatrice du projet PAMPA Senior scientist Head of PAMPA project <http://wwz.ifremer.fr/pampa/> http://wwz.ifremer.fr/pampa/ IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex Nouvelle-Calédonie Tél. (687) 285171 Fax. (687) 287857 -- Dominique PELLETIER Cadre de recherche Biodiversité Coordinatrice du projet PAMPA Senior scientist Head of PAMPA project <http://wwz.ifremer.fr/pampa/> http://wwz.ifremer.fr/pampa/ IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex Nouvelle-Calédonie Tél. (687) 285171 Fax. (687) 287857

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Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets]
by Dominique PELLETIER March 15, 2011

March 15, 2011

Merci Bastien, dans ce cas, il faut savoir si on modifie dans le code puisque c'était prévu d'avoir un min de temps entre deux sorties Dominique Bastien Preuss a écrit : > > Pas évident de ne pas s'embrouiller 1) entre ce qui est comptabilisé > en jours et ce qui est comptabilisé en heures et 2) entre les > paramètres utilisés dans les équations et ceux qui ne le sont pas (on > ne voit pas la différence lors de la saisie). Par exemple dans le > manuel utilisateur le temps minimal entre deux trajets est indiqué en > jours, mais c'est bien en heures qu'il faut le mettre d'après les > équations. > > Donc de ce coté, c'est bon pour Jessica qui a donné une durée de 16h. > Mais effectivement ce temps minimum entre les trajets ne semble pas > être pris en compte dans les équations, on le constate très bien en > modifiant la valeur du temps minimal entre deux trajets qui ne modifie > pas le nombre de trajets. > > Du coup l'équation est plutôt : > > > > > > > > > > Bastien > > > > > > > > > > *De :* Dominique PELLETIER [mailto:Dominique.Pelletier@ifremer.fr] > *Envoyé :* mardi 15 mars 2011 13:44 > *À :* PREUSS > *Objet :* [Fwd: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de > trajets] > > > > salut Bastien, > > tu as aussi été confronté à ce problème ? > Domi > > > -------- Message original -------- > > *Sujet: * > > > > [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets > > *Date: * > > > > Mon, 14 Mar 2011 23:04:13 +0000 > > *De: * > > > > Jessica Andre <Jessica.Andre(a)utas.edu.au> > <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> > > *Répondre à :: * > > > > isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > > *Pour :: * > > > > isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > <isis-fish-users(a)list.isis-fish.org> > <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> > > > > > Bonjour, > > > > Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les > stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. > > D'après l'article Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est > défini comme : > > > > (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / > (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) > > > > Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h > > Comme j'ai défini un metier "inactivité" dans mes stratégies, j'ai > fixé MinNbInactDays à 0. > > Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour l'avoir en > heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca > m'affiche 93 trajets, c'est-a-dire que ISIS ne prends pas en compte > le MinTimeBetweenTrips... > > > > Pourquoi ?! Je n'arrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS > fait ce calcul... > > > > Merci d'avance. > > > > Jess > > > > *************************************************************************************** > > *Dr Jessica André* > > Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) > > Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) > > Marine Research Laboratories, Private Bag 49 > > Hobart, TAS 7001, Australia > > > > Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 > > Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 > > Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> > > Web: > http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 > > > > `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> > > > > > > > > > > -- > > Dominique PELLETIER > > Cadre de recherche Biodiversité > > Coordinatrice du projet PAMPA > > /Senior scientist/ > > /Head of PAMPA project/ > > http://wwz.ifremer.fr/pampa/ > > > > IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex > > Nouvelle-Calédonie > > Tél. (687) 285171 > > Fax. (687) 287857 > -- Dominique PELLETIER Cadre de recherche Biodiversité Coordinatrice du projet PAMPA /Senior scientist/ /Head of PAMPA project/ http://wwz.ifremer.fr/pampa/ IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex Nouvelle-Calédonie Tél. (687) 285171 Fax. (687) 287857

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Re: [Isis-fish-users] [Fwd: Question sur le calcul du nombre de trajets]
by Bastien Preuss March 15, 2011

March 15, 2011

Pas évident de ne pas sembrouiller 1) entre ce qui est comptabilisé en jours et ce qui est comptabilisé en heures et 2) entre les paramètres utilisés dans les équations et ceux qui ne le sont pas (on ne voit pas la différence lors de la saisie). Par exemple dans le manuel utilisateur le temps minimal entre deux trajets est indiqué en jours, mais cest bien en heures quil faut le mettre daprès les équations. Donc de ce coté, cest bon pour Jessica qui a donné une durée de 16h. Mais effectivement ce temps minimum entre les trajets ne semble pas être pris en compte dans les équations, on le constate très bien en modifiant la valeur du temps minimal entre deux trajets qui ne modifie pas le nombre de trajets. Du coup léquation est plutôt : Bastien De : Dominique PELLETIER [mailto:Dominique.Pelletier@ifremer.fr] Envoyé : mardi 15 mars 2011 13:44 À : PREUSS Objet : [Fwd: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets] salut Bastien, tu as aussi été confronté à ce problème ? Domi -------- Message original -------- Sujet: [Isis-fish-users] Question sur le calcul du nombre de trajets Date: Mon, 14 Mar 2011 23:04:13 +0000 De: Jessica Andre <mailto:Jessica.Andre@utas.edu.au> <Jessica.Andre(a)utas.edu.au> Répondre à :: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Pour :: isis-fish-users(a)list.isis-fish.org <mailto:isis-fish-users@list.isis-fish.org> <isis-fish-users(a)list.isis-fish.org> Bonjour, Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. Daprès larticle Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est défini comme : (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h Comme jai défini un metier inactivité dans mes stratégies, jai fixé MinNbInactDays à 0. Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour lavoir en heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca maffiche 93 trajets, cest-a-dire que ISIS ne prends pas en compte le MinTimeBetweenTrips Pourquoi ?! Je narrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS fait ce calcul... Merci davance. Jess **************************************************************************** *********** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> -- Dominique PELLETIER Cadre de recherche Biodiversité Coordinatrice du projet PAMPA Senior scientist Head of PAMPA project <http://wwz.ifremer.fr/pampa/> http://wwz.ifremer.fr/pampa/ IFREMER BP 2059, 98846 Nouméa Cedex Nouvelle-Calédonie Tél. (687) 285171 Fax. (687) 287857

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Question sur le calcul du nombre de trajets
by Jessica Andre March 14, 2011

March 14, 2011

Bonjour, Une petite question sur le calcul du nombre de trajets dans les stratégies, qui sont trop haut dans mon cas. D'après l'article Pelletier et al (2009), le nombre de trajets est défini comme : (Duration(month)-MinNbInactDays(st,t)) / (TripDuration(str,t)+MinTimeBetweenTrips(str,t)) Dans mon cas, TripDuration=8h et MinTimeBetweenTrips=16h Comme j'ai défini un metier "inactivité" dans mes stratégies, j'ai fixé MinNbInactDays à 0. Donc pour le mois de janvier, Duration(month)=31 (*24 pour l'avoir en heure), je devrais obtenir un affichage de 31 trajets, mais ca m'affiche 93 trajets, c'est-a-dire que ISIS ne prends pas en compte le MinTimeBetweenTrips... Pourquoi ?! Je n'arrive pas a trouver dans les dossiers java ou ISIS fait ce calcul... Merci d'avance. Jess *************************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º>

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Bug potentiel
by Jessica Andre March 14, 2011

March 14, 2011

Bonjour, J'ai downloade la dernière version d'ISIS-Fish et j'ai quelques soucis : 1. Apres éteint le programme, ISIS a changé spontanément (2 fois...) mon nombre de classe d'âge pour 2 de mes 4 populations au rallumage. Ca ne l'a pas refait depuis mais je voudrais être sure que ca ne le refasse pas dans le future.... 2. Dans le même style, pour l'une de mes population, ISIS a conservé les données dans l'onglet « Saisie des populations » et « Zones » mais a effacé tout le reste de mes données/équations pour la population. 3. Dans l'interface des scripts, je ne peut pas accéder au formules. Certaines apparaissent en vert et son incompréhensible. Un message d'erreur apparait quelque soit celle sur laquelle je clique : Erreur Message: java.lang.StringIndexOutOfBoundsException: String index out of range: -1 Level: SEVERE Stack Trace: String index out of range: -1 java.lang.String.substring(Unknown Source) fr.ifremer.isisfish.ui.script.ScriptAction.loadScript(ScriptAction.java:451) fr.ifremer.isisfish.ui.script.ScriptAction.valueChanged(ScriptAction.java:414) javax.swing.JTree.fireValueChanged(Unknown Source) javax.swing.JTree$TreeSelectionRedirector.valueChanged(Unknown Source) javax.swing.tree.DefaultTreeSelectionModel.fireValueChanged(Unknown Source) javax.swing.tree.DefaultTreeSelectionModel.notifyPathChange(Unknown Source) javax.swing.tree.DefaultTreeSelectionModel.setSelectionPaths(Unknown Source) javax.swing.tree.DefaultTreeSelectionModel.setSelectionPath(Unknown Source) javax.swing.JTree.setSelectionPath(Unknown Source) javax.swing.plaf.basic.BasicTreeUI.selectPathForEvent(Unknown Source) javax.swing.plaf.basic.BasicTreeUI$Handler.handleSelection(Unknown Source) javax.swing.plaf.basic.BasicTreeUI$Handler.mousePressed(Unknown Source) java.awt.Component.processMouseEvent(Unknown Source) javax.swing.JComponent.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.Component.processEvent(Unknown Source) java.awt.Container.processEvent(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) Merci d'avance! Jess *************************************************************************************** Dr Jessica André Junior Research Fellow (Wild Fisheries Program) Institute for Marine and Antarctic Studies (IMAS) Marine Research Laboratories, Private Bag 49 Hobart, TAS 7001, Australia Ph: (03) 6227 7284 /Int: +61 3 6227 7284 Fax: (03) 6227 8035 /Int: +61 3 6227 8035 Email: Jessica.Andre(a)utas.edu.au Web: http://fcms.its.utas.edu.au/scieng/mrl/pagedetails.asp?lPersonId=3177 `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º> `·.,, ><(((º>

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Re: [Isis-fish-users] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible
by Bastien Preuss March 10, 2011

March 10, 2011

OK, du coup je vais encore rester en version 32bits. Merci. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : vendredi 11 mars 2011 09:03 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible > SAlut Eric, > > Concernant la version 64bits d'Isis, est-ce que le fait qu'il y est > maintenant une vraie version 64bits d'ISIS veut dire que l'on peu > bénéficier > pleinement des avantage du 64bits, ou est-ce qu'il n'y aura pas de > changement sur la vitesse de calcul? Non, car java n'en tire pas avantage lui même. Pour le calcul scientifique, c'est meme plus lent. > D'autre part, est-ce que tout est opérationnel sur la version 64bits? Oui. -- Éric Chatellier _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible
by Bastien Preuss March 10, 2011

March 10, 2011

SAlut Eric, Concernant la version 64bits d'Isis, est-ce que le fait qu'il y est maintenant une vraie version 64bits d'ISIS veut dire que l'on peu bénéficier pleinement des avantage du 64bits, ou est-ce qu'il n'y aura pas de changement sur la vitesse de calcul? D'autre part, est-ce que tout est opérationnel sur la version 64bits? Merci. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : vendredi 21 janvier 2011 04:55 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org; isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org Objet : [Isis-fish-users] Isis-Fish 3.3.0.7 est disponible Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.c gi/about/download Changements : * ajout des scripts de lancement pour la version 64bits Note: * les fichier go.bat et go.sh ont été renommés en isisfish.bat et isisfish.sh pour le version normale et isisfish64.bat et isisfish64.sh pour la version 64bits * attention a n'utiliser la version 64bits que si java et R sont également en 64bits Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.c gi/v3/news -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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