Bonjour les lutins, Je rencontre un soucis en faisant tourner mes simus sur caparmor : elles sont exécutées extrêmement lentement. Pour donner un ordre d'idée, sur mon AS précédente il n'avait fallu que quelques heures pour faire 5000 simulations avec 75 paramètres. Là je repars de la même AS de base, mais je n'ai plus que 25 paramètres, et alors que l'AS à tourné toute la nuit je n'en suis qu'à 2800 simus. En faisant un qstat pour suivre l'avancement des simus, j'ai la forte impression qu'elles ne sont faites que 4 par 4, et de plus j'ai Resource_List.ncpus = 1... Ca veut dire qu'effectivement je ne tourne que sur 1 processeur (4 coeurs) ?? Déjà que 4 processeurs ça ne faisait pas lourd... Voilà, si vous savez d'où vient le problème et comment il peut être réglé je suis preneur, car voir mes simus tourner à cette vitesse c'est presque une punition ! Loïc
Le 16/10/2012 09:13, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour les lutins,
Je rencontre un soucis en faisant tourner mes simus sur caparmor : elles sont exécutées extrêmement lentement.
Pour donner un ordre d'idée, sur mon AS précédente il n'avait fallu que quelques heures pour faire 5000 simulations avec 75 paramètres. Là je repars de la même AS de base, mais je n'ai plus que 25 paramètres, et alors que l'AS à tourné toute la nuit je n'en suis qu'à 2800 simus.
En faisant un qstat pour suivre l'avancement des simus, j'ai la forte impression qu'elles ne sont faites que 4 par 4, le qstat du job montre : array_state_count = Queued:6690 Running:16 Exiting:0 Expired:3294
et de plus j'ai Resource_List.ncpus = 1... Ca veut dire qu'effectivement je ne tourne que sur 1 processeur (4 coeurs) ?? Déjà que 4 processeurs ça ne faisait pas lourd... Je ne sais pas trop ce que Resource_List.ncpus veut dire, mais ce n'est peut etre pas parlant
running : 16, donc il les fait bien toujours par 16. pour un multi jobs, c'était pas " = 1" avant ? Caparmor est peut-etre surchargé, donc plus lent que d'habitude. Si la lenteur persiste, je demanderais à l'admin ce qu'il se passe. -- Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com
Le 16/10/2012 11:57, Eric Chatellier a écrit :
Le 16/10/2012 09:13, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour les lutins,
Je rencontre un soucis en faisant tourner mes simus sur caparmor : elles sont exécutées extrêmement lentement.
Pour donner un ordre d'idée, sur mon AS précédente il n'avait fallu que quelques heures pour faire 5000 simulations avec 75 paramètres. Là je repars de la même AS de base, mais je n'ai plus que 25 paramètres, et alors que l'AS à tourné toute la nuit je n'en suis qu'à 2800 simus.
En faisant un qstat pour suivre l'avancement des simus, j'ai la forte impression qu'elles ne sont faites que 4 par 4, le qstat du job montre : array_state_count = Queued:6690 Running:16 Exiting:0 Expired:3294
running : 16, donc il les fait bien toujours par 16.
et de plus j'ai Resource_List.ncpus = 1... Ca veut dire qu'effectivement je ne tourne que sur 1 processeur (4 coeurs) ?? Déjà que 4 processeurs ça ne faisait pas lourd... Je ne sais pas trop ce que Resource_List.ncpus veut dire, mais ce n'est peut etre pas parlant pour un multi jobs, c'était pas " = 1" avant ?
Caparmor est peut-etre surchargé, donc plus lent que d'habitude.
Si la lenteur persiste, je demanderais à l'admin ce qu'il se passe.
Résultat des courses depuis ce matin : seulement 900 simus en 5 heures... J'ai essayé de faire un mail à Tina pour savoir si cela venait d'un soucis avec caparmor, mais je n'ai pas eu de réponse pour le moment.
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