MorrisClean crée un RData avec 2AS différentes ?
Bonjour, Après l'épopée des parenthèses de ces derniers jours, me revoilà avec encore plus de questions bizarres ! J'ai fait tourner des AS plus conséquentes pour comparer la méthode Morris avec MorrisClean, et je me retrouve avec quelque chose d'assez étrange : Pour ma première AS (Morris) j'ai bien le RData correspondant, mais pour ma seconde AS (MorrisClean) le RData contient à la fois les résultats de cette AS et ceux de l'AS précédente réalisée avec la méthode de Morris. Cela n'était pas arrivé avec mes petites AS de test de MorrisClean précédentes. Pour couronner le tout je me retrouve avec un debug de 750Mo que je n'arrive pas à ouvrir : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R50edb0458e6dedd730679fc81f20365a Voilà... encore une fausse manip' ? Loïc -- Loïc Gasche Doctorant Unité Ecologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH) IFREMER - Centre de Nantes
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Le 26/01/2012 11:26, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Après l'épopée des parenthèses de ces derniers jours, me revoilà avec encore plus de questions bizarres !
J'ai fait tourner des AS plus conséquentes pour comparer la méthode Morris avec MorrisClean, et je me retrouve avec quelque chose d'assez étrange : Pour ma première AS (Morris) j'ai bien le RData correspondant, mais pour ma seconde AS (MorrisClean) le RData contient à la fois les résultats de cette AS et ceux de l'AS précédente réalisée avec la méthode de Morris.
Cela n'était pas arrivé avec mes petites AS de test de MorrisClean précédentes.
Pour couronner le tout je me retrouve avec un debug de 750Mo que je n'arrive pas à ouvrir : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R50edb0458e6dedd730679fc81f20365a
Voilà... encore une fausse manip' ?
Etrange, tu peux essayer avec la méthode en PJ ? Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPITQMAAoJEFOQdnjKiPj3dYsH/0lgYQWYhZQ+3h/Lj/p9JLD4 KpjfcqYGH2JMtIcnuriOF6XkgzkrcyLZpeD6MBC5ffA7Fgrist20XereCtm1gb4e OaGclSgJTmy7EEy98qGWyFiFXTbmWiZCx4Er7pVntZZ6YIHmjwzSc2Aa97JhLm5s ErUWWZyZODnSyE4WgznsNEQPc/yBw8c/U5yvYXRtkUhWHaxwYPFq/YGeHI18IDeT iZCq+ayTgwJOA7wPaYu8QSuMucps1kpA/IFs+floGMoMsqEHvSxHomgh2NUcrSX8 B50j6HeAjFReHshsGeXAuqjgpbxQzWiA7am7MvTwEZt1x6WTkrA8K5RmpXUKvsI= =AcxR -----END PGP SIGNATURE-----
Bonjour, J'ai fait tourner des simus avec la méthode "MorrisCleanBis". Isis signale un problème quand je lui dit de l'utiliser : C:\Users\lgasche\isis-fish-4\isis-community-database\sensitivityanalysis\SensitivityCalculatorRMorrisCleanBis.java:53: class SensitivityCalculatorRMorrisClean is public, should be declared in a file named SensitivityCalculatorRMorrisClean.java public class SensitivityCalculatorRMorrisClean ^ 1 error mais les simus tournent quand même... A première vue je dirais qu'il ne fait pas tourner MorrisCleanBis mais Morris tout court (C'est possible ??) car quand je charge ma simu avec ISIS c'est Morris qui est affiché comme méthode et car les variables intermédiaires qui devraient être nettoyées réapparaissent dans le RData. Et le problème n'est pas résolu : je me retrouve toujours avec un Rdata qui contient les résultats de 2 simus pour la seconde simu qui a tourné... Donc si ma supposition est bonne je devrais avoir un RData "double" même en faisant tourner deux simus à la suite avec la méthode de Morris ? Je vais terster ça pour voir... Voilà. Loïc Jean Couteau a écrit :
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1
Le 26/01/2012 11:26, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Après l'épopée des parenthèses de ces derniers jours, me revoilà avec encore plus de questions bizarres !
J'ai fait tourner des AS plus conséquentes pour comparer la méthode Morris avec MorrisClean, et je me retrouve avec quelque chose d'assez étrange : Pour ma première AS (Morris) j'ai bien le RData correspondant, mais pour ma seconde AS (MorrisClean) le RData contient à la fois les résultats de cette AS et ceux de l'AS précédente réalisée avec la méthode de Morris.
Cela n'était pas arrivé avec mes petites AS de test de MorrisClean précédentes.
Pour couronner le tout je me retrouve avec un debug de 750Mo que je n'arrive pas à ouvrir : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R50edb0458e6dedd730679fc81f20365a
Voilà... encore une fausse manip' ?
Etrange, tu peux essayer avec la méthode en PJ ?
Jean
-----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
iQEcBAEBAgAGBQJPITQMAAoJEFOQdnjKiPj3dYsH/0lgYQWYhZQ+3h/Lj/p9JLD4 KpjfcqYGH2JMtIcnuriOF6XkgzkrcyLZpeD6MBC5ffA7Fgrist20XereCtm1gb4e OaGclSgJTmy7EEy98qGWyFiFXTbmWiZCx4Er7pVntZZ6YIHmjwzSc2Aa97JhLm5s ErUWWZyZODnSyE4WgznsNEQPc/yBw8c/U5yvYXRtkUhWHaxwYPFq/YGeHI18IDeT iZCq+ayTgwJOA7wPaYu8QSuMucps1kpA/IFs+floGMoMsqEHvSxHomgh2NUcrSX8 B50j6HeAjFReHshsGeXAuqjgpbxQzWiA7am7MvTwEZt1x6WTkrA8K5RmpXUKvsI= =AcxR -----END PGP SIGNATURE-----
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-- Loïc Gasche Doctorant Unité Ecologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH) IFREMER - Centre de Nantes
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Le 30/01/2012 16:13, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
J'ai fait tourner des simus avec la méthode "MorrisCleanBis". Isis signale un problème quand je lui dit de l'utiliser :
C:\Users\lgasche\isis-fish-4\isis-community-database\sensitivityanalysis\SensitivityCalculatorRMorrisCleanBis.java:53:
class SensitivityCalculatorRMorrisClean is public, should be declared in
a file named SensitivityCalculatorRMorrisClean.java public class SensitivityCalculatorRMorrisClean ^ 1 error
En fait l'erreur est assez explicite si tu lis bien le message : tu as renommé le fichier en MorrisCleanBis et ça lui plait pas parce que la classe s'appelle MorrisClean et que le nom de fichier doit être le même. Donc soit tu renommes le fichier en MorrisClean (en virant au passage l'ancien MorrisClean), soit tu édites MorrisCleanBis et tu renommes : "public class SensitivityCalculatorRMorrisClean extends..." en "public class SensitivityCalculatorRMorrisCleanBis extends ..." Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPJtgnAAoJEFOQdnjKiPj3sTYH/i/GElcANs+7cJ4QWSMY19RN MUGjt74NOdu4VdS3UCeZcI5cIeTH9hJV/TYvbW8ddKvlmXh+EghtG5Ipn67vzXkP gTj8TkG5fdY6pqN8ttkEFp7XKCuDIbJyIWSvvs0cf3osRquaBo4A3PCIrvHA9yyc +KhHMKTcB3HJZvA2s+wf+fCYQXYFWNHXWOm68HhASmaowk+MZAmG2R2yWxX20b50 gmhUnJBApTMcFnK0LYx55fsfCPrT7K6AcJ/8wbspXnhsbsDJEFFIPZoV8lboYvur 1IekM6quggOQVgfQkS5cesVy6lZpobZxW+y533rkxJzKlbJoNj5q7VU1t7MKogw= =fobQ -----END PGP SIGNATURE-----
Bonjour, Ah oui j'avais complètement oublié que c'était moi qui avait renommé MorrisClean en MorrisCleanBis... Par contre j'ai aussi fait tourner deux AS à la suite avec la "vieille" méthode de Morris, et je me retrouve encore avec un RData "normal" pour la première, et un RData avec les sorties des deux AS pour la deuxième AS. Loïc Jean Couteau a écrit :
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1
Le 30/01/2012 16:13, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
J'ai fait tourner des simus avec la méthode "MorrisCleanBis". Isis signale un problème quand je lui dit de l'utiliser :
C:\Users\lgasche\isis-fish-4\isis-community-database\sensitivityanalysis\SensitivityCalculatorRMorrisCleanBis.java:53:
class SensitivityCalculatorRMorrisClean is public, should be declared in
a file named SensitivityCalculatorRMorrisClean.java public class SensitivityCalculatorRMorrisClean ^ 1 error
En fait l'erreur est assez explicite si tu lis bien le message : tu as renommé le fichier en MorrisCleanBis et ça lui plait pas parce que la classe s'appelle MorrisClean et que le nom de fichier doit être le même. Donc soit tu renommes le fichier en MorrisClean (en virant au passage l'ancien MorrisClean), soit tu édites MorrisCleanBis et tu renommes : "public class SensitivityCalculatorRMorrisClean extends..." en "public class SensitivityCalculatorRMorrisCleanBis extends ..."
Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
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-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Le 31/01/2012 09:30, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Ah oui j'avais complètement oublié que c'était moi qui avait renommé MorrisClean en MorrisCleanBis...
Par contre j'ai aussi fait tourner deux AS à la suite avec la "vieille" méthode de Morris, et je me retrouve encore avec un RData "normal" pour la première, et un RData avec les sorties des deux AS pour la deuxième AS.
C'est normal, avec le nouveau MorrisClean ça donne quoi ? Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPKo5zAAoJEFOQdnjKiPj3i1UH/jwDxoUZGOkJQ6aIUWmx4b3w 5R6NSDxKmIY5qe6rS8VINxxvInBukD1oo3gx2MeVWPv++mwcp3atH7vER0F+r2WU 07aIrha7qx2/Zyvb5emvQjR4UUK9t2SroUbZzLHLxbKAQBLNzFFn0pohJALVu6AK XixeCafPLu5xFPp62Hbt9PC1KQqt6XHHOodI7fGwojcpSRfsR33vulAMp585n0i6 OI0a9khzRUeDOLFWEXETU5Rgnl/FrPz+pamyUd/kpSvP1f5z0AAhUSjGjmsHO4yQ E+dAHIY60M4b99hb35O8HYkr2jUvCJkqlaa4WmTBdk8L9jwbKVpxbDr+A+t3H08= =bDDI -----END PGP SIGNATURE-----
Bonjour, Le problème subsiste avec le nouveau MorrisClean... Jean Couteau a écrit :
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1
Le 31/01/2012 09:30, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Ah oui j'avais complètement oublié que c'était moi qui avait renommé MorrisClean en MorrisCleanBis...
Par contre j'ai aussi fait tourner deux AS à la suite avec la "vieille" méthode de Morris, et je me retrouve encore avec un RData "normal" pour la première, et un RData avec les sorties des deux AS pour la deuxième AS.
C'est normal, avec le nouveau MorrisClean ça donne quoi ?
Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
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-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Le 02/02/2012 16:15, Loic GASCHE a écrit :
Le problème subsiste avec le nouveau MorrisClean...
Bon, le problème ne se reproduit pas sur Linux mais se reproduit sur Windows... As-tu changé de version de R récemment ? Quelle version de R utilises-tu ? Peux tu essayer de passer dans une session R avec quelques objets (sans importance, ils devraient être supprimés), la commande rm(list=ls()) ? - -- Jean Couteau - Code Lutin Tel : 02.40.50.29.28 Port : 06.68.07.29.29 -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPOnFMAAoJEFOQdnjKiPj3ckgH/A5a/V6vKCT36fOI9y/4q3II G3XRRz5krb1/D+u0H1FK51/X0NU0HKeuBHNI6NWGFGtKUmpfV0s4hymNZWU8lL2k i2xEp7vxTzydV0OOU/ww+mHwW+uJRogtk2TBY5KvFP4pQABGkwE7zypJ+anzBn58 l6otpMifsyFNA4hdEnx9w5T2NOvaHwDeOoaSXTVHSeJFcLf4Ai4jnfZtWRXToTlk UJHsu9uS5Jr+15qLVbX5m1S3YMv96u9Sq7P2n64oZmKhiW12QgKtA0bgo3RITMt3 A3AXeG2xzyuQQZwjzNJ7/dCQlgjVsyp6ptJK0+51whvE0Yxuv/MUzAqMtFDSw1k= =qe6r -----END PGP SIGNATURE-----
Bonjour, Non je n'ai pas changé de version de R récemment, j'ai la version 2.13.0 Si je reprends un de mes vieux RData au hasard et que je fais rm(list=ls()) puis à nouveau ls(), R me dit character(0) : on dirait effectivement que tout a été supprimé. Loïc Jean Couteau a écrit :
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1
Le 02/02/2012 16:15, Loic GASCHE a écrit :
Le problème subsiste avec le nouveau MorrisClean...
Bon, le problème ne se reproduit pas sur Linux mais se reproduit sur Windows...
As-tu changé de version de R récemment ?
Quelle version de R utilises-tu ?
Peux tu essayer de passer dans une session R avec quelques objets (sans importance, ils devraient être supprimés), la commande rm(list=ls()) ?
- -- Jean Couteau - Code Lutin Tel : 02.40.50.29.28 Port : 06.68.07.29.29 -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
iQEcBAEBAgAGBQJPOnFMAAoJEFOQdnjKiPj3ckgH/A5a/V6vKCT36fOI9y/4q3II G3XRRz5krb1/D+u0H1FK51/X0NU0HKeuBHNI6NWGFGtKUmpfV0s4hymNZWU8lL2k i2xEp7vxTzydV0OOU/ww+mHwW+uJRogtk2TBY5KvFP4pQABGkwE7zypJ+anzBn58 l6otpMifsyFNA4hdEnx9w5T2NOvaHwDeOoaSXTVHSeJFcLf4Ai4jnfZtWRXToTlk UJHsu9uS5Jr+15qLVbX5m1S3YMv96u9Sq7P2n64oZmKhiW12QgKtA0bgo3RITMt3 A3AXeG2xzyuQQZwjzNJ7/dCQlgjVsyp6ptJK0+51whvE0Yxuv/MUzAqMtFDSw1k= =qe6r -----END PGP SIGNATURE----- _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Bonjour, On avait le problème sur Windows, mais on ne l'a plus, sans rien changer. Je pense en fait qu'ISIS ne prends pas la bonne version de l'AS. Est-ce que tu peux refaire un test en allant d'abord voir la méthode dans l'éditeur d'ISIS et de la valider et puis ensuite lancer les deux AS. Jean Le 14/02/2012 17:05, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Non je n'ai pas changé de version de R récemment, j'ai la version 2.13.0
Si je reprends un de mes vieux RData au hasard et que je fais rm(list=ls()) puis à nouveau ls(), R me dit character(0) : on dirait effectivement que tout a été supprimé.
Loïc
Jean Couteau a écrit : Le 02/02/2012 16:15, Loic GASCHE a écrit :
Le problème subsiste avec le nouveau MorrisClean...
Bon, le problème ne se reproduit pas sur Linux mais se reproduit sur Windows...
As-tu changé de version de R récemment ?
Quelle version de R utilises-tu ?
Peux tu essayer de passer dans une session R avec quelques objets (sans importance, ils devraient être supprimés), la commande rm(list=ls()) ?
Jean Couteau - Code Lutin Tel : 02.40.50.29.28 Port : 06.68.07.29.29 -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPPPa+AAoJEFOQdnjKiPj3r0EH/1Fpua1vqz7icEL17aYqA/ZP YcSfxFDPZOfRNWOTrUupCfqs5Ut+YiQV6MObxDrNhw0vxDyO81RclV+N+L2p6b+y 0bxDcTcHy5n3hFyUUVQLq1ouY9WSTkqtMK9u74TnRSwzaiyzZl89UuU4SGA0tzAE YpPywnUVQiZ3SVI5F92NXSdcXbrbz1v0NeAod52Y9sAxco2uzufJ/j9YyxUZCL8R fNLsVYGc8pQ/8In9YmmeqqfWrNkBQyepVJklzGLXF1hrq0vFZjdGwxAQ5ytRTPN7 cdhZbGhDbdSdE2RoWdoMLLpwYEVJamUo/oiLeTfBqSbcLC+7ivHdgfmXZQ9VAI8= =sdb8 -----END PGP SIGNATURE-----
Bonjour, Je suis allé voir les scripts d'AS dans les VCS et pour Morris et MorrisClean j'ai fait "vérifier" puis "sauver". J'ai ensuite refait tourner 2 AS à la suite et là le problème semble avoir disparu : chacun des RData créés ne contient que les objets lui correspondant. Loïc Le 16/02/2012 13:29, Jean Couteau a écrit :
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1
Bonjour,
On avait le problème sur Windows, mais on ne l'a plus, sans rien changer. Je pense en fait qu'ISIS ne prends pas la bonne version de l'AS.
Est-ce que tu peux refaire un test en allant d'abord voir la méthode dans l'éditeur d'ISIS et de la valider et puis ensuite lancer les deux AS.
Jean
Le 14/02/2012 17:05, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Non je n'ai pas changé de version de R récemment, j'ai la version 2.13.0
Si je reprends un de mes vieux RData au hasard et que je fais rm(list=ls()) puis à nouveau ls(), R me dit character(0) : on dirait effectivement que tout a été supprimé.
Loïc
Jean Couteau a écrit : Le 02/02/2012 16:15, Loic GASCHE a écrit :
Le problème subsiste avec le nouveau MorrisClean...
Bon, le problème ne se reproduit pas sur Linux mais se reproduit sur Windows...
As-tu changé de version de R récemment ?
Quelle version de R utilises-tu ?
Peux tu essayer de passer dans une session R avec quelques objets (sans importance, ils devraient être supprimés), la commande rm(list=ls()) ?
Jean Couteau - Code Lutin Tel : 02.40.50.29.28 Port : 06.68.07.29.29 -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
iQEcBAEBAgAGBQJPPPa+AAoJEFOQdnjKiPj3r0EH/1Fpua1vqz7icEL17aYqA/ZP YcSfxFDPZOfRNWOTrUupCfqs5Ut+YiQV6MObxDrNhw0vxDyO81RclV+N+L2p6b+y 0bxDcTcHy5n3hFyUUVQLq1ouY9WSTkqtMK9u74TnRSwzaiyzZl89UuU4SGA0tzAE YpPywnUVQiZ3SVI5F92NXSdcXbrbz1v0NeAod52Y9sAxco2uzufJ/j9YyxUZCL8R fNLsVYGc8pQ/8In9YmmeqqfWrNkBQyepVJklzGLXF1hrq0vFZjdGwxAQ5ytRTPN7 cdhZbGhDbdSdE2RoWdoMLLpwYEVJamUo/oiLeTfBqSbcLC+7ivHdgfmXZQ9VAI8= =sdb8 -----END PGP SIGNATURE----- _______________________________________________ Isis-fish-devel mailing list Isis-fish-devel@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE----- Hash: SHA1 Le 16/02/2012 15:28, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
Je suis allé voir les scripts d'AS dans les VCS et pour Morris et MorrisClean j'ai fait "vérifier" puis "sauver". J'ai ensuite refait tourner 2 AS à la suite et là le problème semble avoir disparu : chacun des RData créés ne contient que les objets lui correspondant.
Ouf on a fini par trouver, j'ai cru devenir fou.... En fait le problème vient du dépot community qui comporte un bug. Il ne prenait jamais la bonne méthode d'AS. J'ai créé un bug dans la forge (http://forge.codelutin.com/issues/846). En attendant la résolution, il faut penser à aller vérifier les scripts du dépot community avant de les utiliser. Jean -----BEGIN PGP SIGNATURE----- Version: GnuPG v2.0.18 (GNU/Linux) Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/ iQEcBAEBAgAGBQJPPSYuAAoJEFOQdnjKiPj3Zn0H/iOIjkl1d0NF+jp5Q2DumBZS AmgYQFosOnKVTgziovr5Lk3Ce5fcfyQBgEPpTZgAKHIY6+IkeMxv100ns0joY5rL z9Az8M+GYproXaLj7iPktyJUXx0h4ehFNqTBDMkwV4zlAKcpgM5MiHCuGLJ8pv0D BjthaDuuqgZLCawcc8ir3vC5Lh4BLpi5Lj0JaijVigUUlDXj9317nMrSR4v9+CTP 4DUodoxTf8VjgEvurBkA1k1uETQSfX/FSHD/e8BNEy0AqMYWyZMxVajcbFE4EiEP BBaTEbH/yHU1TyQCLvBGT3Rm+z1pSN9pz+2Ti7yGvlUQsKFbEsoHsSpgT6P07pM= =fCyR -----END PGP SIGNATURE-----
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