Bonsoir, Je suis entrain de configurer ISIS 4.4.0.2 pour pouvoir appeler R dans ISIS. -Est-ce que ça sert à quelque chose que j'utilise Rserve? -Je suis la doc du site : j'ai un Java 1.8 64 bit et un R 3.2.2 64 bit. J'ai installé rJava, j'ai redéfini la variable d'environnement correctement (je suis malheureusement contraint de travailler sous Windows). Pourtant quand je teste la configuration R dans ISIS, ce n'est pas bon (le dernier champ est rouge avec le même message d'erreur que dans la doc du site ("Le path ne contient pas le dossier bin de R" ....alors qu'en fait si, ce répertoire existe bien)). Qu'est-ce que je dois faire d'autre pour que ça fonctionne? -Par ailleurs, quand j'utilise une première fois le bouton "tester" dans configuration de R, ISIS m'indique qu'il me manque deux librairies d'AS, alors que je les ai installées (sous R 3.2.2 64 bit). Il n'y a pas moyen d'enlever ces 2 warnings? Suite à ça, il y a bien un test. Par contre si je demande une deuxième fois, ISIS plante. Bon week-end Audric -- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail : audric.vigier@ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)
Le 18/11/2016 à 18:45, Audric Vigier a écrit :
Bonsoir,
Je suis entrain de configurer ISIS 4.4.0.2 pour pouvoir appeler R dans ISIS. -Est-ce que ça sert à quelque chose que j'utilise Rserve?
-Je suis la doc du site : j'ai un Java 1.8 64 bit et un R 3.2.2 64 bit. J'ai installé rJava, j'ai redéfini la variable d'environnement correctement (je suis malheureusement contraint de travailler sous Windows). Pourtant quand je teste la configuration R dans ISIS, ce n'est pas bon (le dernier champ est rouge avec le même message d'erreur que dans la doc du site ("Le path ne contient pas le dossier bin de R" ....alors qu'en fait si, ce répertoire existe bien)). Qu'est-ce que je dois faire d'autre pour que ça fonctionne? Au debut du fichier debug.txt il y a des informations concernant la configuration de Isis, java et R.
Tu peux regarder et me l'envoyer si tu ne comprends pas ? -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28
Bonjour, Nouvelle journée, nouveau comportement d'ISIS : -j'ai ouvert ISIS avec le même .bat que vendredi -je demande un test de la configuration R : ISIS me renvoie le message en PJ. -je le fais 2 autres fois de suite : ISIS me renvoie le même message et ne plante pas. Comme j'ai redémarré depuis vendredi, ça a du avoir du bon pour ISIS. J'ai aussi joint le debug. J'y lis : -Java version: 1.8.0_111-b14, Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM -Starting Isis-Fish 4.4.0.2 with args : [] -R_HOME: C:\Program Files\R\R-3.2.2 Le 19/11/2016 16:57, Eric Chatellier a écrit :
Le 18/11/2016 à 18:45, Audric Vigier a écrit :
Bonsoir,
Je suis entrain de configurer ISIS 4.4.0.2 pour pouvoir appeler R dans ISIS. -Est-ce que ça sert à quelque chose que j'utilise Rserve?
-Je suis la doc du site : j'ai un Java 1.8 64 bit et un R 3.2.2 64 bit. J'ai installé rJava, j'ai redéfini la variable d'environnement correctement (je suis malheureusement contraint de travailler sous Windows). Pourtant quand je teste la configuration R dans ISIS, ce n'est pas bon (le dernier champ est rouge avec le même message d'erreur que dans la doc du site ("Le path ne contient pas le dossier bin de R" ....alors qu'en fait si, ce répertoire existe bien)). Qu'est-ce que je dois faire d'autre pour que ça fonctionne? Au debut du fichier debug.txt il y a des informations concernant la configuration de Isis, java et R.
Tu peux regarder et me l'envoyer si tu ne comprends pas ?
-- Audric Vigier Doctorant à Ifremer, unités EMH (Nantes) et STH/LBH (Brest) E-mail :audric.vigier@ifremer.fr Tel : +33 (0)2 40 37 41 64 (8164)
Le 21/11/2016 09:57, Audric Vigier a écrit :
Bonjour,
Nouvelle journée, nouveau comportement d'ISIS :
-j'ai ouvert ISIS avec le même .bat que vendredi -je demande un test de la configuration R : ISIS me renvoie le message en PJ.
Tu as mis des / au lieu de \ dans le PATH. C:\Program Files\R\R-3.2.2/bin/x64 C'est pour ca que Isis ne détecte pas une bonne configuration, mais pas sûr que ensuite cela fonctionne mieux.
-je le fais 2 autres fois de suite : ISIS me renvoie le même message et ne plante pas. Comme j'ai redémarré depuis vendredi, ça a du avoir du bon pour ISIS.
Heu non, c'est Isis est quand même déterministe, le comportement ne change pas au cours du temps :)
Le 21/11/2016 10:18, Eric Chatellier a écrit :
Le 21/11/2016 09:57, Audric Vigier a écrit :
Bonjour,
Nouvelle journée, nouveau comportement d'ISIS :
-j'ai ouvert ISIS avec le même .bat que vendredi -je demande un test de la configuration R : ISIS me renvoie le message en PJ.
Tu as mis des / au lieu de \ dans le PATH. C:\Program Files\R\R-3.2.2/bin/x64
C'est pour ca que Isis ne détecte pas une bonne configuration, mais pas sûr que ensuite cela fonctionne mieux.
Effectivement il y avait ça. je viens de changer, et dans la configuration R/ISIS, les 3 champs sont blancs, mais j'ai toujours le même message d'erreur.
-je le fais 2 autres fois de suite : ISIS me renvoie le même message et ne plante pas. Comme j'ai redémarré depuis vendredi, ça a du avoir du bon pour ISIS.
Heu non, c'est Isis est quand même déterministe, le comportement ne change pas au cours du temps :) _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
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Le 21/11/2016 10:43, Audric Vigier a écrit :
C'est pour ca que Isis ne détecte pas une bonne configuration, mais pas sûr que ensuite cela fonctionne mieux.
Effectivement il y avait ça. je viens de changer, et dans la configuration R/ISIS, les 3 champs sont blancs, mais j'ai toujours le même message d'erreur.
En testant sous windows, j'ai le meme probleme. Il faut que j'investigue un peu...
Le 21/11/2016 11:10, Eric Chatellier a écrit :
Effectivement il y avait ça. je viens de changer, et dans la configuration R/ISIS, les 3 champs sont blancs, mais j'ai toujours le même message d'erreur.
En testant sous windows, j'ai le meme probleme. Il faut que j'investigue un peu...
J'ai trouvé, il y a un bug dans Isis ou un changement récent dans la librairie rJava ou R. En attendant une correction, voici un contournement: Dans le dossier C:\Program Files\R\R-3.3.2\library\rJava\jri il y a un fichier jri.dll. Il faudrait le remplacer par celui du dossier C:\Program Files\R\R-3.3.2\library\rJava\jri\x64
Le 21/11/2016 11:54, Eric Chatellier a écrit :
Le 21/11/2016 11:10, Eric Chatellier a écrit :
Effectivement il y avait ça. je viens de changer, et dans la configuration R/ISIS, les 3 champs sont blancs, mais j'ai toujours le même message d'erreur.
En testant sous windows, j'ai le meme probleme. Il faut que j'investigue un peu...
J'ai trouvé, il y a un bug dans Isis ou un changement récent dans la librairie rJava ou R.
En attendant une correction, voici un contournement:
Dans le dossier C:\Program Files\R\R-3.3.2\library\rJava\jri il y a un fichier jri.dll.
Il faudrait le remplacer par celui du dossier C:\Program Files\R\R-3.3.2\library\rJava\jri\x64
Super ça marche. Merci!
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