July 2013 - Tutti-commits - mailman.cloud.codelutin.com

r1144 - trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/benthos/frequency
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

16 Jul '13

Author: tchemit Date: 2013-07-16 19:50:28 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1144 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1144 Log: fixes #2880: [MENSURATION] generation des classes avec un pas de 0.1 (fix alos for benthos) Modified: trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/benthos/frequency/BenthosFrequencyUIHandler.java Modified: trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/benthos/frequency/BenthosFrequencyUIHandler.java =================================================================== --- trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/benthos/frequency/BenthosFrequencyUIHandler.java 2013-07-16 17:48:55 UTC (rev 1143) +++ trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/benthos/frequency/BenthosFrequencyUIHandler.java 2013-07-16 17:50:28 UTC (rev 1144) @@ -398,7 +398,9 @@ Float maxStep = model.getLengthStep(model.getMaxStep()); Caracteristic lengthStepCaracteristic = model.getLengthStepCaracteristic(); - for (float i = minStep, step = model.getStep(); i <= maxStep; i += step) { + for (float i = minStep, step = model.getStep(); i <= maxStep; + i = model.getLengthStep(i+step)) { + if (!rowsByStep.containsKey(i)) { // add it

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r1143 - tags
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: tchemit Date: 2013-07-16 19:48:55 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1143 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1143 Log: remove bad release Removed: tags/tutti-2.3.3/

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r1142 - in trunk: . tutti-persistence tutti-service tutti-ui-swing
by maven-release＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: maven-release Date: 2013-07-16 19:46:22 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1142 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1142 Log: [maven-release-plugin] prepare for next development iteration Modified: trunk/pom.xml trunk/tutti-persistence/pom.xml trunk/tutti-service/pom.xml trunk/tutti-ui-swing/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2013-07-16 17:46:13 UTC (rev 1141) +++ trunk/pom.xml 2013-07-16 17:46:22 UTC (rev 1142) @@ -32,7 +32,7 @@ <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3</version> + <version>2.4-SNAPSHOT</version> <packaging>pom</packaging> <name>Tutti</name> @@ -86,12 +86,12 @@ </modules> <scm> - <url>http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3</url> + <url>http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk</url> <connection> - scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3 + scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk </connection> <developerConnection> - scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3 + scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk </developerConnection> </scm> <distributionManagement> Modified: trunk/tutti-persistence/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-persistence/pom.xml 2013-07-16 17:46:13 UTC (rev 1141) +++ trunk/tutti-persistence/pom.xml 2013-07-16 17:46:22 UTC (rev 1142) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3</version> + <version>2.4-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId> Modified: trunk/tutti-service/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-service/pom.xml 2013-07-16 17:46:13 UTC (rev 1141) +++ trunk/tutti-service/pom.xml 2013-07-16 17:46:22 UTC (rev 1142) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3</version> + <version>2.4-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId> Modified: trunk/tutti-ui-swing/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-ui-swing/pom.xml 2013-07-16 17:46:13 UTC (rev 1141) +++ trunk/tutti-ui-swing/pom.xml 2013-07-16 17:46:22 UTC (rev 1142) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3</version> + <version>2.4-SNAPSHOT</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId>

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r1141 - tags
by maven-release＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: maven-release Date: 2013-07-16 19:46:13 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1141 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1141 Log: [maven-release-plugin] copy for tag tutti-2.3.3 Added: tags/tutti-2.3.3/

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r1140 - in trunk: . tutti-persistence tutti-service tutti-ui-swing
by maven-release＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: maven-release Date: 2013-07-16 19:46:04 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1140 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1140 Log: [maven-release-plugin] prepare release tutti-2.3.3 Modified: trunk/pom.xml trunk/tutti-persistence/pom.xml trunk/tutti-service/pom.xml trunk/tutti-ui-swing/pom.xml Modified: trunk/pom.xml =================================================================== --- trunk/pom.xml 2013-07-16 17:40:26 UTC (rev 1139) +++ trunk/pom.xml 2013-07-16 17:46:04 UTC (rev 1140) @@ -32,7 +32,7 @@ <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3-SNAPSHOT</version> + <version>2.3.3</version> <packaging>pom</packaging> <name>Tutti</name> @@ -86,12 +86,12 @@ </modules> <scm> - <url>http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk</url> + <url>http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3</url> <connection> - scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk + scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3 </connection> <developerConnection> - scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/trunk + scm:svn:http://svn.forge.codelutin.com/svn/tutti/tags/tutti-2.3.3 </developerConnection> </scm> <distributionManagement> Modified: trunk/tutti-persistence/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-persistence/pom.xml 2013-07-16 17:40:26 UTC (rev 1139) +++ trunk/tutti-persistence/pom.xml 2013-07-16 17:46:04 UTC (rev 1140) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3-SNAPSHOT</version> + <version>2.3.3</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId> Modified: trunk/tutti-service/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-service/pom.xml 2013-07-16 17:40:26 UTC (rev 1139) +++ trunk/tutti-service/pom.xml 2013-07-16 17:46:04 UTC (rev 1140) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3-SNAPSHOT</version> + <version>2.3.3</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId> Modified: trunk/tutti-ui-swing/pom.xml =================================================================== --- trunk/tutti-ui-swing/pom.xml 2013-07-16 17:40:26 UTC (rev 1139) +++ trunk/tutti-ui-swing/pom.xml 2013-07-16 17:46:04 UTC (rev 1140) @@ -27,7 +27,7 @@ <parent> <groupId>fr.ifremer</groupId> <artifactId>tutti</artifactId> - <version>2.3.3-SNAPSHOT</version> + <version>2.3.3</version> </parent> <groupId>fr.ifremer.tutti</groupId>

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r1139 - trunk/src/update
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

16 Jul '13

Author: tchemit Date: 2013-07-16 19:40:26 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1139 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1139 Log: fixes #2871: [TECH] Erreur dans les logs lors de la mise ?\195?\160 jour Modified: trunk/src/update/update-tutti.properties Modified: trunk/src/update/update-tutti.properties =================================================================== --- trunk/src/update/update-tutti.properties 2013-07-16 14:56:40 UTC (rev 1138) +++ trunk/src/update/update-tutti.properties 2013-07-16 17:40:26 UTC (rev 1139) @@ -29,6 +29,7 @@ jre.version=@jreVersion@ linux.i386.jre.url=zip:http://nexus.nuiton.org/nexus/content/repositories/j… windows.i386.jre.url=zip:http://nexus.nuiton.org/nexus/content/repositories… +windows.x86.jre.url=zip:http://nexus.nuiton.org/nexus/content/repositories/jvm/com/oracle/jre/@jreVersion@/jre-@jreVersion@-windows-i586.zip #linux.amd64.jre.url=zip:http://nexus.nuiton.org/nexus/content/repositories/jvm/com/oracle/jre/@jreVersion@/jre-@jreVersion@-linux-x64.zip #windows.amd64.jre.url=zip:http://nexus.nuiton.org/nexus/content/repositories/jvm/com/oracle/jre/@jreVersion@/jre-@jreVersion@-windows-x64.zip

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r1138 - trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/species/frequency
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: tchemit Date: 2013-07-16 16:56:40 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1138 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1138 Log: fixes #2880: [MENSURATION] generation des classes avec un pas de 0.1 Modified: trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/species/frequency/SpeciesFrequencyUIHandler.java Modified: trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/species/frequency/SpeciesFrequencyUIHandler.java =================================================================== --- trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/species/frequency/SpeciesFrequencyUIHandler.java 2013-07-16 14:33:14 UTC (rev 1137) +++ trunk/tutti-ui-swing/src/main/java/fr/ifremer/tutti/ui/swing/content/operation/catches/species/frequency/SpeciesFrequencyUIHandler.java 2013-07-16 14:56:40 UTC (rev 1138) @@ -61,6 +61,9 @@ import java.awt.event.KeyEvent; import java.beans.PropertyChangeEvent; import java.beans.PropertyChangeListener; +import java.math.BigDecimal; +import java.math.MathContext; +import java.math.RoundingMode; import java.util.Collections; import java.util.List; import java.util.Map; @@ -114,9 +117,9 @@ protected boolean isRowValid(SpeciesFrequencyRowModel row) { return row.getLengthStepCaracteristic() != null && row.getLengthStep() != null && - ((row.getNumber() == null && row.getWeight() == null) || - (row.getNumber() != null && row.getNumber() > 0 && - (withWeightRows.isEmpty() || row.getWeight() != null && row.getWeight() > 0))); + ((row.getNumber() == null && row.getWeight() == null) || + (row.getNumber() != null && row.getNumber() > 0 && + (withWeightRows.isEmpty() || row.getWeight() != null && row.getWeight() > 0))); } @Override @@ -398,7 +401,9 @@ Float maxStep = model.getLengthStep(model.getMaxStep()); Caracteristic lengthStepCaracteristic = model.getLengthStepCaracteristic(); - for (float i = minStep, step = model.getStep(); i <= maxStep; i += step) { + for (float i = minStep, step = model.getStep(); i <= maxStep; + i = model.getLengthStep(i+step)) { + if (!rowsByStep.containsKey(i)) { // add it

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r1137 - in trunk/tutti-service/src: main/java/fr/ifremer/tutti/service/export test/java/fr/ifremer/tutti/service/export
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 16 Jul '13

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Author: tchemit Date: 2013-07-16 16:33:14 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1137 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1137 Log: fixes #2877: [Export generique] ?\195?\169cart par rapport aux attentes Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-16 14:33:14 UTC (rev 1137) @@ -122,11 +122,15 @@ Float speciesCatchRaisingFactor, Float benthosCatchRaisingFactor) { + Caracteristic weightMeasuredCaracteristic = persistenceService.getWeightMeasuredCaracteristic(); + String batchWeightUnit = weightMeasuredCaracteristic.getUnit(); + for (SpeciesBatch speciesBatch : rootSpeciesBatch.getChildren()) { CatchExportRow row = new CatchExportRow(); row.setCruise(cruise); row.setFishingOperation(operation); row.setSpecies(speciesBatch.getSpecies()); + row.setBatchWeightUnit(batchWeightUnit); if (TuttiEntities.isVracSpeciesBatch(speciesBatch)) { @@ -154,6 +158,7 @@ row.setCruise(cruise); row.setFishingOperation(operation); row.setSpecies(benthosBatch.getSpecies()); + row.setBatchWeightUnit(batchWeightUnit); if (TuttiEntities.isVracBenthosBatch(benthosBatch)) { @@ -463,7 +468,7 @@ newNullableColumnForExport("Tot_" + headerPrefix, categoryName + "." + ExportSampleCategory.PROPERTY_CATEGORY_WEIGHT, TuttiCsvUtil.FLOAT); newNullableColumnForExport("Ech_" + headerPrefix, categoryName + "." + ExportSampleCategory.PROPERTY_SAMPLE_WEIGHT, TuttiCsvUtil.FLOAT); newNullableColumnForExport("Type_Volume_Poids_" + headerPrefix, categoryName + "." + ExportSampleCategory.PROPERTY_WEIGHT_OR_VOL_TYPE); - newNullableColumnForExport("Unite_Volume_Poids_" + headerPrefix, categoryName + "." + ExportSampleCategory.PROPERTY_CATEGORY_CARACTERISTIC + "." + Caracteristic.PROPERTY_UNIT); + newNullableColumnForExport("Unite_Volume_Poids_" + headerPrefix, CatchExportRow.BATCH_WEIGHT_UNIT); } } \ No newline at end of file Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java 2013-07-16 14:33:14 UTC (rev 1137) @@ -85,6 +85,8 @@ public static final String BATCH_NUMBER = "batchNumber"; + public static final String BATCH_WEIGHT_UNIT = "batchWeightUnit"; + protected Cruise cruise; protected FishingOperation fishingOperation; @@ -105,6 +107,8 @@ protected Integer batchNumber; + protected String batchWeightUnit; + protected final List<String> comment = Lists.newArrayList(); public void setCruise(Cruise cruise) { @@ -227,6 +231,14 @@ return batchNumber; } + public String getBatchWeightUnit() { + return batchWeightUnit; + } + + public void setBatchWeightUnit(String batchWeightUnit) { + this.batchWeightUnit = batchWeightUnit; + } + public CatchExportRow copy() { CatchExportRow result = new CatchExportRow(); result.setCruise(cruise); @@ -243,6 +255,7 @@ result.setRaisingFactor(raisingFactor); result.setReferenceWeight(referenceWeight); result.setBatchNumber(batchNumber); + result.setBatchWeightUnit(batchWeightUnit); result.comment.addAll(comment); return result; Modified: trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) +++ trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-16 14:33:14 UTC (rev 1137) @@ -75,25 +75,25 @@ public static final String CATCH_CONTENT = "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom_scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-vrac-80;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;5.4444447;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-male 60;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;9.074075;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;907.4074;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;1361.1111;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-horsvrac-20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-vrac 80;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;3.5;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Male 60;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;5.8333335;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Femelle 40.0;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;40.0;8.75;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-horsvrac 20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-vrac-80;Vrac;1;80.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;80.0;5.4444447;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-male 60;Vrac;2;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Mâle;1;60.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;60.0;9.074075;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Femelle;2;40.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;907.4074;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Femelle;2;40.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;1361.1111;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-horsvrac-20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-vrac 80;Vrac;1;80.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;80.0;3.5;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Male 60;Vrac;2;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Mâle;1;60.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;60.0;5.8333335;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Femelle 40.0;Vrac;2;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Femelle;2;40.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;40.0;8.75;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-horsvrac 20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;4622;Abietinaria abietina;\"Trait B-2-1 Benthos ABIEABI Vrac 30\n" + "\n" + "avec \n" + "\n" + - "commentaire...\";Vrac;1;30.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;30.0;7.0;\n" + + "commentaire...\";Vrac;1;30.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;30.0;7.0;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;380;Acanthocardia echinata;\"Trait B-2-1 Benthos ACANECH Vrac 18\n" + "\n" + "avec \n" + "\n" + - "commentaire...\";Vrac;2;18.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;18.0;7.0;"; + "commentaire...\";Vrac;2;18.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;18.0;7.0;"; protected TuttiExportService service; Modified: trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) +++ trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java 2013-07-16 14:33:14 UTC (rev 1137) @@ -109,47 +109,47 @@ public static final String CATCH_CONTENT = "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom_scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Mâle;1;30.0;;Poids;;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.0;1;;cm;0.5;5;5.0;20.0;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Mâle;1;30.0;;Poids;;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;2;;cm;0.5;2;5.0;20.0;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Mâle;1;30.0;;Poids;;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;11.0;3;;cm;0.5;1;5.0;20.0;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Mâle;1;30.0;;Poids;;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;11.0;1;;cm;0.5;5;10.0;10.0;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;;NA;;;;;;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;10.0;1;;cm;;5;30.0;3.3333333;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;;NA;;;;;;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;11.0;2;;cm;;6;30.0;3.3333333;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;;G - Gros;1;80.0;;Poids;;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;;NA;;;;;;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;12.0;3;;cm;;7;30.0;3.3333333;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|;Vrac;1;100.0;;Poids;;M - Moyen;2;20.0;;Poids;;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;5.0;\n" + - "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;2;20.0;1.0;"; + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Mâle;1;30.0;;Poids;kg;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.0;1;;cm;0.5;5;5.0;20.0;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Mâle;1;30.0;;Poids;kg;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;2;;cm;0.5;2;5.0;20.0;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Mâle;1;30.0;;Poids;kg;1 - Stade 1;1;10.0;5.0;Poids;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;11.0;3;;cm;0.5;1;5.0;20.0;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Mâle;1;30.0;;Poids;kg;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;11.0;1;;cm;0.5;5;10.0;10.0;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;kg;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;10.0;1;;cm;;5;30.0;3.3333333;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;kg;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;11.0;2;;cm;;6;30.0;3.3333333;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;||;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;G - Gros;1;80.0;;Poids;kg;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;kg;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;1425;Longueur totale (LT) - individu - queue - Mesure au cm par un observateur;12.0;3;;cm;;7;30.0;3.3333333;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;|;Vrac;1;100.0;;Poids;kg;M - Moyen;2;20.0;;Poids;kg;Femelle;2;50.0;30.0;Poids;kg;3 - Stade 3;3;10.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;;20.0;5.0;\n" + + "2013;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;A;1;1;278970;11242;Aaptos;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;2;20.0;1.0;"; public static final String CATCH_CONTENT_2 = "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom_scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;365;Aequipecten opercularis;taxon;Vrac;1;0.005;0.005;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;1;0.005;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;491;Alloteuthis;taxon;Vrac;2;0.004;0.004;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;1;0.004;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;300;Buccinum undatum;taxon;Vrac;3;0.015;0.015;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;1;0.015;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1811;Callionymus lyra;taxon;Vrac;4;0.07;0.07;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;1;0.07;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1644;Dicentrarchus labrax;taxon;Vrac;5;1.06;1.06;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;36.0;1;;cm;1.0;1;1.06;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1644;Dicentrarchus labrax;taxon;Vrac;5;1.06;1.06;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;38.0;2;;cm;1.0;1;1.06;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;1;;cm;0.5;2;0.038;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;12.5;2;;cm;0.5;1;0.038;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;13.0;3;;cm;0.5;1;0.038;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;25.0;1;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;28.0;2;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;30.0;3;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;9.0;1;;cm;1.0;1;0.28;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;10.0;2;;cm;1.0;3;0.28;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;11.0;3;;cm;1.0;2;0.28;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1988;Microstomus kitt;taxon;Vrac;9;0.152;0.152;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;15.0;1;;cm;1.0;1;0.152;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1988;Microstomus kitt;taxon;Vrac;9;0.152;0.152;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;18.0;2;;cm;1.0;1;0.152;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1690;Mullus surmuletus;taxon;Vrac;10;0.036;0.036;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;11.0;1;;cm;1.0;1;0.036;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1978;Pleuronectes platessa;taxon;Vrac;11;0.852;0.852;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;26.0;1;;cm;1.0;1;0.852;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1978;Pleuronectes platessa;taxon;Vrac;11;0.852;0.852;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;30.0;2;;cm;1.0;1;0.852;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1351;Sardina pilchardus;taxon;Vrac;12;0.022;0.022;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;1;;cm;0.5;1;0.022;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1772;Scomber scombrus;taxon;Vrac;13;0.18;0.18;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;27.0;1;;cm;1.0;1;0.18;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;51.0;1;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;55.0;2;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;8.0;1;;cm;1.0;1;0.96;136.71875;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;9.0;2;;cm;1.0;20;0.96;136.71875;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;10.0;3;;cm;1.0;89;0.96;136.71875;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;11.0;4;;cm;1.0;5;0.96;136.71875;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;G - Gros;2;0.13;0.13;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;23.0;1;;cm;1.0;1;0.13;1009.6154;"; + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;365;Aequipecten opercularis;taxon;Vrac;1;0.005;0.005;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;1;0.005;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;491;Alloteuthis;taxon;Vrac;2;0.004;0.004;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;1;0.004;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;300;Buccinum undatum;taxon;Vrac;3;0.015;0.015;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;1;0.015;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1811;Callionymus lyra;taxon;Vrac;4;0.07;0.07;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;;;;;;;;1;0.07;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1644;Dicentrarchus labrax;taxon;Vrac;5;1.06;1.06;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;36.0;1;;cm;1.0;1;1.06;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1644;Dicentrarchus labrax;taxon;Vrac;5;1.06;1.06;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;38.0;2;;cm;1.0;1;1.06;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;1;;cm;0.5;2;0.038;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;12.5;2;;cm;0.5;1;0.038;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1362;Engraulis encrasicolus;taxon;Vrac;6;0.038;0.038;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;13.0;3;;cm;0.5;1;0.038;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;25.0;1;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;28.0;2;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1986;Limanda limanda;taxon;Vrac;7;0.66;0.66;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;30.0;3;;cm;1.0;1;0.66;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;9.0;1;;cm;1.0;1;0.28;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;10.0;2;;cm;1.0;3;0.28;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;489;Loligo vulgaris;taxon;Vrac;8;0.28;0.28;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;302;Longueur du manteau (LM) - individu - manteau - Mesure au cm par un observateur;11.0;3;;cm;1.0;2;0.28;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1988;Microstomus kitt;taxon;Vrac;9;0.152;0.152;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;15.0;1;;cm;1.0;1;0.152;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1988;Microstomus kitt;taxon;Vrac;9;0.152;0.152;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;18.0;2;;cm;1.0;1;0.152;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1690;Mullus surmuletus;taxon;Vrac;10;0.036;0.036;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;11.0;1;;cm;1.0;1;0.036;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1978;Pleuronectes platessa;taxon;Vrac;11;0.852;0.852;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;26.0;1;;cm;1.0;1;0.852;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1978;Pleuronectes platessa;taxon;Vrac;11;0.852;0.852;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;30.0;2;;cm;1.0;1;0.852;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1351;Sardina pilchardus;taxon;Vrac;12;0.022;0.022;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;307;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au 1/2 cm par un observateur;10.5;1;;cm;0.5;1;0.022;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1772;Scomber scombrus;taxon;Vrac;13;0.18;0.18;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;27.0;1;;cm;1.0;1;0.18;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;51.0;1;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;kg;NA;;;;;kg;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;55.0;2;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;kg;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;8.0;1;;cm;1.0;1;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;kg;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;9.0;2;;cm;1.0;20;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;kg;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;10.0;3;;cm;1.0;89;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;kg;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;NA;;;;;kg;306;Longueur totale (LT) - individu - 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r1136 - in trunk/tutti-service/src: main/java/fr/ifremer/tutti/service/export test/java/fr/ifremer/tutti/service/export
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16 Jul '13

Author: tchemit Date: 2013-07-16 15:12:23 +0200 (Tue, 16 Jul 2013) New Revision: 1136 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1136 Log: refs #2877: [Export generique] ?\195?\169cart par rapport aux attentes Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportModel.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportRow.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -41,8 +41,6 @@ import fr.ifremer.tutti.service.PersistenceService; import fr.ifremer.tutti.service.TuttiCsvUtil; import org.apache.commons.collections.CollectionUtils; -import org.apache.commons.logging.Log; -import org.apache.commons.logging.LogFactory; import java.io.Serializable; import java.util.List; @@ -56,9 +54,6 @@ */ public class CatchExportModel extends TuttiCsvUtil.AbstractTuttiExportModel<CatchExportRow> { - /** Logger. */ - private static final Log log = LogFactory.getLog(CatchExportModel.class); - public static final String WEIGHT_OR_VOL_TYPE = "Poids"; Map<SampleCategoryEnum, Caracteristic> sampleCategoryToCaracteristics; @@ -79,7 +74,7 @@ newColumnForExport("Poche", FishingOperation.PROPERTY_MULTIRIG_AGGREGATION); newColumnForExport("Navire", Cruise.PROPERTY_VESSEL, TuttiCsvUtil.VESSEL_VALUE_FORMATTER); newColumnForExport("Taxon", SpeciesBatch.PROPERTY_SPECIES + "." + Species.PROPERTY_REFERENCE_TAXON_ID, TuttiCsvUtil.INTEGER); - newColumnForExport("Nom scientifique", SpeciesBatch.PROPERTY_SPECIES + "." + Species.PROPERTY_NAME); + newColumnForExport("Nom_scientifique", SpeciesBatch.PROPERTY_SPECIES + "." + Species.PROPERTY_NAME); newColumnForExport("Commentaire", SpeciesBatch.PROPERTY_COMMENT); for (SampleCategoryEnum sampleCategoryEnum : samplingOrder) { @@ -132,7 +127,6 @@ row.setCruise(cruise); row.setFishingOperation(operation); row.setSpecies(speciesBatch.getSpecies()); - row.addComment(speciesBatch.getComment()); if (TuttiEntities.isVracSpeciesBatch(speciesBatch)) { @@ -145,10 +139,11 @@ float totalBatchWeight = speciesCatchRaisingFactor * sortedBatchWeight; - prepareSortedRows(persistenceService, row, rows, + prepareSortedRows(persistenceService, + row, + rows, speciesBatch, - totalBatchWeight - ); + totalBatchWeight); } else { prepareUnsortedRows(row, rows, speciesBatch); } @@ -159,7 +154,7 @@ row.setCruise(cruise); row.setFishingOperation(operation); row.setSpecies(benthosBatch.getSpecies()); - row.addComment(benthosBatch.getComment()); + if (TuttiEntities.isVracBenthosBatch(benthosBatch)) { // compute species total weight in catch @@ -171,7 +166,9 @@ float totalBatchWeight = benthosCatchRaisingFactor * sortedBatchWeight; - prepareSortedRows(persistenceService, row, rows, + prepareSortedRows(persistenceService, + row, + rows, benthosBatch, totalBatchWeight); } else { @@ -186,6 +183,8 @@ SpeciesBatch speciesBatch, final float totalBatchWeight) { + currentRow.addComment(speciesBatch.getComment()); + prepareBatch(currentRow, speciesBatch.getSampleCategoryType(), speciesBatch.getSampleCategoryValue(), @@ -202,30 +201,6 @@ List<SpeciesBatchFrequency> speciesBatchFrequency = persistenceService.getAllSpeciesBatchFrequency(speciesBatch.getId()); - // check if there is a sub sampling weight - // if so then adapt raisingFactor - -// Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// speciesBatch.getWeight(), speciesBatch.getComputedWeight()); -// -// if (subWeight != null) { -// -// float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), -// speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); -// -// if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { -// // sub sample, adapt raising factor -// raisingFactor *= batchWeight / subWeight; -// -// if (log.isDebugEnabled()) { -// log.debug("Using a sub sample on leaf : " + -// subWeight + " out of " + batchWeight + -// ", new raising Factor= " + raisingFactor); -// } -// } -// } - if (CollectionUtils.isEmpty(speciesBatchFrequency)) { // no frequency @@ -287,38 +262,6 @@ } else { - // Yet another sample category to walk through - - // Compute total child weights (to adapt raising factor if necessary) - -// float childTotalWeight = 0f; -// for (SpeciesBatch childBatch : speciesBatch.getChildBatchs()) { -// float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// childBatch.getSampleCategoryWeight(), -// childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); -// childTotalWeight += childWeight; -// } - -// float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), -// speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - -// if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { -// -// // there is a sub sampling -// // adapt raising factor -// -// // sub sample, adapt raising factor -// raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; -// -// if (log.isDebugEnabled()) { -// log.debug("Using a sub sample for childs of category " + -// speciesBatch + ": " + childTotalWeight + -// " out of " + currentWeight + -// ", new raising Factor= " + raisingFactor); -// } -// } - for (SpeciesBatch childBatch : speciesBatch.getChildBatchs()) { prepareSortedRows(persistenceService, currentRow, @@ -328,12 +271,17 @@ ); } } + + // remove last comment (otherwise next brother will have this one too...) + currentRow.popLastComment(); } protected void prepareUnsortedRows(CatchExportRow currentRow, List<CatchExportRow> rows, SpeciesBatch speciesBatch) { + + prepareBatch(currentRow, speciesBatch.getSampleCategoryType(), speciesBatch.getSampleCategoryValue(), @@ -344,14 +292,12 @@ speciesBatch.getRankOrder()); CatchExportRow row = currentRow.copy(); + row.addComment(speciesBatch.getComment()); float referenceWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); setRaisingFactor(row, referenceWeight, referenceWeight); - -// row.setReferenceWeight(referenceWeight); -// row.setRaisingFactor(1.f); rows.add(row); } @@ -361,6 +307,8 @@ BenthosBatch benthosBatch, final float totalBatchWeight) { + currentRow.addComment(benthosBatch.getComment()); + prepareBatch(currentRow, benthosBatch.getSampleCategoryType(), benthosBatch.getSampleCategoryValue(), @@ -377,31 +325,6 @@ List<BenthosBatchFrequency> benthosBatchFrequency = persistenceService.getAllBenthosBatchFrequency(benthosBatch.getId()); -// // check if there is a sub sampling weight -// // if so then adapt raisingFactor -// -// Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// benthosBatch.getWeight(), -// benthosBatch.getComputedWeight()); -// -// if (subWeight != null) { -// -// float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), -// benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); -// -// if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { -// // sub sample, adapt raising factor -// raisingFactor *= batchWeight / subWeight; -// -// if (log.isDebugEnabled()) { -// log.debug("Using a sub sample on leaf : " + subWeight -// + " out of " + batchWeight + -// ", new raising Factor= " + raisingFactor); -// } -// } -// } - if (CollectionUtils.isEmpty(benthosBatchFrequency)) { // no frequency @@ -463,38 +386,6 @@ } else { - // Yet another sample category to walk through - - // Compute total child weights (to adapt raising factor if necessary) - -// float childTotalWeight = 0f; -// for (BenthosBatch childBatch : benthosBatch.getChildBatchs()) { -// float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// childBatch.getSampleCategoryWeight(), -// childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); -// childTotalWeight += childWeight; -// } - -// Float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( -// benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), -// benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); -// -// if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { -// -// // there is a sub sampling -// // adapt raising factor -// -// // sub sample, adapt raising factor -// raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; -// -// if (log.isDebugEnabled()) { -// log.debug("Using a sub sample for childs of category " + -// benthosBatch + ": " + childTotalWeight + -// " out of " + currentWeight + -// ", new raising Factor= " + raisingFactor); -// } -// } - for (BenthosBatch childBatch : benthosBatch.getChildBatchs()) { prepareSortedRows(persistenceService, currentRow, @@ -503,6 +394,9 @@ totalBatchWeight); } } + + // remove last comment (otherwise next brother will have this one too...) + currentRow.popLastComment(); } protected void prepareUnsortedRows(CatchExportRow currentRow, @@ -519,6 +413,7 @@ benthosBatch.getRankOrder()); CatchExportRow row = currentRow.copy(); + row.addComment(benthosBatch.getComment()); float referenceWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportRow.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -38,6 +38,8 @@ import fr.ifremer.tutti.persistence.entities.referential.Species; import fr.ifremer.tutti.persistence.entities.referential.Vessel; import org.apache.commons.lang3.StringUtils; +import org.apache.commons.logging.Log; +import org.apache.commons.logging.LogFactory; import java.io.Serializable; import java.util.Date; @@ -54,6 +56,9 @@ private static final long serialVersionUID = 1L; + /** Logger. */ + private static final Log log = LogFactory.getLog(CatchExportRow.class); + public static final String FREQUENCY_LENGTH_STEP = "frequency.lengthStep"; public static final String FREQUENCY_NUMBER = "frequency.number"; @@ -100,7 +105,7 @@ protected Integer batchNumber; - protected List<String> comment; + protected final List<String> comment = Lists.newArrayList(); public void setCruise(Cruise cruise) { this.cruise = cruise; @@ -238,20 +243,28 @@ result.setRaisingFactor(raisingFactor); result.setReferenceWeight(referenceWeight); result.setBatchNumber(batchNumber); - result.comment = comment; + result.comment.addAll(comment); + return result; } public void addComment(String comment) { - if (this.comment == null) { - this.comment = Lists.newArrayList(); + String safeComment = StringUtils.isEmpty(comment) ? "" : comment; + if (log.isDebugEnabled()) { + log.debug("Add comment: " + safeComment); } - this.comment.add(StringUtils.isEmpty(comment) ? "" : comment); + this.comment.add(safeComment); } + public void popLastComment() { + if (!comment.isEmpty()) { + this.comment.remove(this.comment.size() - 1); + } + } + public String getComment() { String result; - if (comment == null) { + if (comment.isEmpty()) { result = ""; } else { result = Joiner.on('|').join(comment); Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportModel.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportModel.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportModel.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -48,7 +48,8 @@ newColumnForExport("Navire", Cruise.PROPERTY_VESSEL, TuttiCsvUtil.VESSEL_VALUE_FORMATTER); newColumnForExport("Pays", SurveyExportRow.PROPERTY_COUNTRY); newColumnForExport("Zone_Etude", Program.PROPERTY_ZONE, TuttiLocation.PROPERTY_NAME); - newColumnForExport("Id_Sismer", Cruise.PROPERTY_NAME); + newColumnForExport("Campagne", Cruise.PROPERTY_NAME); + newColumnForExport("Id_Sismer", SurveyExportRow.PROPERTY_ID_SISMER); // newColumnForExport("Nombre_de_poche", Cruise.PROPERTY_MULTIRIG_NUMBER, TuttiCsvUtil.PRIMITIVE_INTEGER); newColumnForExport("Date_Deb_Campagne", Cruise.PROPERTY_BEGIN_DATE, TuttiCsvUtil.DAY_TIME_SECOND); newColumnForExport("Port_Deb_Campagne", Cruise.PROPERTY_DEPARTURE_LOCATION, TuttiLocation.PROPERTY_NAME); Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportRow.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportRow.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/SurveyExportRow.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -47,6 +47,8 @@ public static final String PROPERTY_COUNTRY = "country"; + public static final String PROPERTY_ID_SISMER = "idSismer"; + protected Cruise cruise; protected TuttiLocation country; @@ -118,4 +120,9 @@ public Integer getMultirigNumber() { return cruise.getMultirigNumber(); } + + // see http://forge.codelutin.com/issues/2877 + public String getIdSismer() { + return ""; + } } Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -154,7 +154,7 @@ String countryId = context.getConfig().getExportCountryId(); country = TuttiEntities.splitById(allCountry).get(countryId); - List<Caracteristic> allCaracteristic = persistenceService.getAllCaracteristic(); + List<Caracteristic> allCaracteristic = persistenceService.getAllCaracteristicWithProtected(); Map<String, Caracteristic> allCaracteristicById = TuttiEntities.splitById(allCaracteristic); samplingToCaracteristic = Maps.newEnumMap(SampleCategoryEnum.class); Modified: trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -74,18 +74,26 @@ public static final String OPERATION_2_ID = "100113"; public static final String CATCH_CONTENT = - "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;5.4444447;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;9.074075;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;907.4074;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;1361.1111;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;3.5;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;5.8333335;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;40.0;8.75;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;4622;Abietinaria abietina;;Vrac;1;30.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;30.0;7.0;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;380;Acanthocardia echinata;;Vrac;2;18.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;18.0;7.0;"; + "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom_scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-vrac-80;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;5.4444447;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-male 60;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;9.074075;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;907.4074;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;ALOSALO-vrac|ALOSALO-vrac-femelle 40;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;1361.1111;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;AGONCAT-horsvrac-20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-vrac 80;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;3.5;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Male 60;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;5.8333335;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;Trait B-2-1 ALOSALO Vrac|Trait B-2-1 ALOSALO Vrac - Femelle 40.0;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;40.0;8.75;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;Trait B-2-1 AGONCAT-horsvrac 20;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;4622;Abietinaria abietina;\"Trait B-2-1 Benthos ABIEABI Vrac 30\n" + + "\n" + + "avec \n" + + "\n" + + "commentaire...\";Vrac;1;30.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;30.0;7.0;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;380;Acanthocardia echinata;\"Trait B-2-1 Benthos ACANECH Vrac 18\n" + + "\n" + + "avec \n" + + "\n" + + "commentaire...\";Vrac;2;18.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;18.0;7.0;"; protected TuttiExportService service; Modified: trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) +++ trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportServiceTest.java 2013-07-16 13:12:23 UTC (rev 1136) @@ -78,8 +78,8 @@ public static final String OPERATION_2_ID = "100107"; public static final String SURVEY_CONTENT = - 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individu - totale - Mesure au cm par un observateur;55.0;2;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;8.0;1;;cm;1.0;1;0.96;136.58333;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;9.0;2;;cm;1.0;20;0.96;136.58333;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;10.0;3;;cm;1.0;89;0.96;136.58333;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;11.0;4;;cm;1.0;5;0.96;136.58333;\n" + - "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon;Vrac;15;;;Poids;;G - Gros;2;0.13;0.13;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;23.0;1;;cm;1.0;1;0.13;1.0;"; + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;51.0;1;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1242;Scyliorhinus canicula;taxon|categorie_individu;Vrac;14;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;1;1.0;1.0;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;55.0;2;;cm;1.0;1;1.0;1.0;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;8.0;1;;cm;1.0;1;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;9.0;2;;cm;1.0;20;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;10.0;3;;cm;1.0;89;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;P - Petit;1;131.12;0.96;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;11.0;4;;cm;1.0;5;0.96;136.71875;\n" + + "2010;Campagne CGFS;;GOV 19.7/25.9;20;20;1;278970;1662;Trachurus trachurus;taxon|categorie_individu;Vrac;15;;;Poids;;G - Gros;2;0.13;0.13;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;23.0;1;;cm;1.0;1;0.13;1009.6154;"; public static final String MARINE_LITTER_CONTENT = "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;MarineLitterCategory;MarineLitterSizeCategory;Number;Weight;Commentaire\n" +

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r1135 - in trunk/tutti-service/src: main/java/fr/ifremer/tutti/service/export test/java/fr/ifremer/tutti/service/export
by tchemit＠users.forge.codelutin.com 12 Jul '13

12 Jul '13

Author: tchemit Date: 2013-07-12 18:07:22 +0200 (Fri, 12 Jul 2013) New Revision: 1135 Url: http://forge.codelutin.com/projects/tutti/repository/revisions/1135 Log: refs #2872: [EXPORT GENERIQUE] le calcul du coef ne marche pas : ex. trait 2 Alosa Alosa Vrac on obtient pas le m?\195?\170me poids dans la capture Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-10 15:47:03 UTC (rev 1134) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/CatchExportModel.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) @@ -135,9 +135,19 @@ row.addComment(speciesBatch.getComment()); if (TuttiEntities.isVracSpeciesBatch(speciesBatch)) { + + // compute species total weight in catch + + float sortedBatchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( + speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), + speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); + + float totalBatchWeight = speciesCatchRaisingFactor * + sortedBatchWeight; + prepareSortedRows(persistenceService, row, rows, speciesBatch, - speciesCatchRaisingFactor + totalBatchWeight ); } else { prepareUnsortedRows(row, rows, speciesBatch); @@ -151,9 +161,19 @@ row.setSpecies(benthosBatch.getSpecies()); row.addComment(benthosBatch.getComment()); if (TuttiEntities.isVracBenthosBatch(benthosBatch)) { + + // compute species total weight in catch + + float sortedBatchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( + benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), + benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); + + float totalBatchWeight = benthosCatchRaisingFactor * + sortedBatchWeight; + prepareSortedRows(persistenceService, row, rows, benthosBatch, - benthosCatchRaisingFactor); + totalBatchWeight); } else { prepareUnsortedRows(row, rows, benthosBatch); } @@ -164,7 +184,7 @@ CatchExportRow currentRow, List<CatchExportRow> rows, SpeciesBatch speciesBatch, - Float raisingFactor) { + final float totalBatchWeight) { prepareBatch(currentRow, speciesBatch.getSampleCategoryType(), @@ -185,27 +205,27 @@ // check if there is a sub sampling weight // if so then adapt raisingFactor - Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - speciesBatch.getWeight(), speciesBatch.getComputedWeight()); +// Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// speciesBatch.getWeight(), speciesBatch.getComputedWeight()); +// +// if (subWeight != null) { +// +// float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), +// speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// +// if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { +// // sub sample, adapt raising factor +// raisingFactor *= batchWeight / subWeight; +// +// if (log.isDebugEnabled()) { +// log.debug("Using a sub sample on leaf : " + +// subWeight + " out of " + batchWeight + +// ", new raising Factor= " + raisingFactor); +// } +// } +// } - if (subWeight != null) { - - float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), - speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - - if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { - // sub sample, adapt raising factor - raisingFactor *= batchWeight / subWeight; - - if (log.isDebugEnabled()) { - log.debug("Using a sub sample on leaf : " + - subWeight + " out of " + batchWeight + - ", new raising Factor= " + raisingFactor); - } - } - } - if (CollectionUtils.isEmpty(speciesBatchFrequency)) { // no frequency @@ -224,9 +244,7 @@ speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); } - setRaisingFactor(row, - raisingFactor, - referenceWeight); + setRaisingFactor(row, totalBatchWeight, referenceWeight); rows.add(row); } else { @@ -263,9 +281,7 @@ referenceWeight = batchFrequency.getWeight(); } - setRaisingFactor(row, - raisingFactor, - referenceWeight); + setRaisingFactor(row, totalBatchWeight, referenceWeight); } } @@ -275,40 +291,40 @@ // Compute total child weights (to adapt raising factor if necessary) - float childTotalWeight = 0f; - for (SpeciesBatch childBatch : speciesBatch.getChildBatchs()) { - float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - childBatch.getSampleCategoryWeight(), - childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - childTotalWeight += childWeight; - } +// float childTotalWeight = 0f; +// for (SpeciesBatch childBatch : speciesBatch.getChildBatchs()) { +// float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// childBatch.getSampleCategoryWeight(), +// childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// childTotalWeight += childWeight; +// } - float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), - speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), +// speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { +// if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { +// +// // there is a sub sampling +// // adapt raising factor +// +// // sub sample, adapt raising factor +// raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; +// +// if (log.isDebugEnabled()) { +// log.debug("Using a sub sample for childs of category " + +// speciesBatch + ": " + childTotalWeight + +// " out of " + currentWeight + +// ", new raising Factor= " + raisingFactor); +// } +// } - // there is a sub sampling - // adapt raising factor - - // sub sample, adapt raising factor - raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; - - if (log.isDebugEnabled()) { - log.debug("Using a sub sample for childs of category " + - speciesBatch + ": " + childTotalWeight + - " out of " + currentWeight + - ", new raising Factor= " + raisingFactor); - } - } - for (SpeciesBatch childBatch : speciesBatch.getChildBatchs()) { prepareSortedRows(persistenceService, currentRow, rows, childBatch, - raisingFactor + totalBatchWeight ); } } @@ -331,8 +347,11 @@ float referenceWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( speciesBatch.getSampleCategoryWeight(), speciesBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - row.setReferenceWeight(referenceWeight); - row.setRaisingFactor(1.f); + + setRaisingFactor(row, referenceWeight, referenceWeight); + +// row.setReferenceWeight(referenceWeight); +// row.setRaisingFactor(1.f); rows.add(row); } @@ -340,7 +359,7 @@ CatchExportRow currentRow, List<CatchExportRow> rows, BenthosBatch benthosBatch, - Float raisingFactor) { + final float totalBatchWeight) { prepareBatch(currentRow, benthosBatch.getSampleCategoryType(), @@ -358,31 +377,31 @@ List<BenthosBatchFrequency> benthosBatchFrequency = persistenceService.getAllBenthosBatchFrequency(benthosBatch.getId()); - // check if there is a sub sampling weight - // if so then adapt raisingFactor +// // check if there is a sub sampling weight +// // if so then adapt raisingFactor +// +// Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// benthosBatch.getWeight(), +// benthosBatch.getComputedWeight()); +// +// if (subWeight != null) { +// +// float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), +// benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// +// if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { +// // sub sample, adapt raising factor +// raisingFactor *= batchWeight / subWeight; +// +// if (log.isDebugEnabled()) { +// log.debug("Using a sub sample on leaf : " + subWeight +// + " out of " + batchWeight + +// ", new raising Factor= " + raisingFactor); +// } +// } +// } - Float subWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - benthosBatch.getWeight(), - benthosBatch.getComputedWeight()); - - if (subWeight != null) { - - float batchWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), - benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - - if (batchWeight - subWeight > 0.0001f) { - // sub sample, adapt raising factor - raisingFactor *= batchWeight / subWeight; - - if (log.isDebugEnabled()) { - log.debug("Using a sub sample on leaf : " + subWeight - + " out of " + batchWeight + - ", new raising Factor= " + raisingFactor); - } - } - } - if (CollectionUtils.isEmpty(benthosBatchFrequency)) { // no frequency @@ -401,9 +420,7 @@ benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); } - setRaisingFactor(row, - raisingFactor, - referenceWeight); + setRaisingFactor(row, totalBatchWeight, referenceWeight); rows.add(row); } else { @@ -440,7 +457,7 @@ referenceWeight = batchFrequency.getWeight(); } - setRaisingFactor(row, raisingFactor, referenceWeight); + setRaisingFactor(row, totalBatchWeight, referenceWeight); } } @@ -450,39 +467,40 @@ // Compute total child weights (to adapt raising factor if necessary) - float childTotalWeight = 0f; - for (BenthosBatch childBatch : benthosBatch.getChildBatchs()) { - float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - childBatch.getSampleCategoryWeight(), - childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - childTotalWeight += childWeight; - } +// float childTotalWeight = 0f; +// for (BenthosBatch childBatch : benthosBatch.getChildBatchs()) { +// float childWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// childBatch.getSampleCategoryWeight(), +// childBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// childTotalWeight += childWeight; +// } - Float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( - benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), - benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// Float currentWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( +// benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), +// benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); +// +// if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { +// +// // there is a sub sampling +// // adapt raising factor +// +// // sub sample, adapt raising factor +// raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; +// +// if (log.isDebugEnabled()) { +// log.debug("Using a sub sample for childs of category " + +// benthosBatch + ": " + childTotalWeight + +// " out of " + currentWeight + +// ", new raising Factor= " + raisingFactor); +// } +// } - if (currentWeight - childTotalWeight > 0.0001f) { - - // there is a sub sampling - // adapt raising factor - - // sub sample, adapt raising factor - raisingFactor *= currentWeight / childTotalWeight; - - if (log.isDebugEnabled()) { - log.debug("Using a sub sample for childs of category " + - benthosBatch + ": " + childTotalWeight + - " out of " + currentWeight + - ", new raising Factor= " + raisingFactor); - } - } for (BenthosBatch childBatch : benthosBatch.getChildBatchs()) { prepareSortedRows(persistenceService, currentRow, rows, childBatch, - raisingFactor); + totalBatchWeight); } } } @@ -505,16 +523,17 @@ float referenceWeight = TuttiExportService.getValueOrComputedValue( benthosBatch.getSampleCategoryWeight(), benthosBatch.getSampleCategoryComputedWeight()); - row.setReferenceWeight(referenceWeight); - row.setRaisingFactor(1.f); + + setRaisingFactor(row, referenceWeight, referenceWeight); + rows.add(row); } protected void setRaisingFactor(CatchExportRow row, - float raisingFactor, + float totalBatchWeight, float referenceWeight) { row.setReferenceWeight(referenceWeight); - row.setRaisingFactor(raisingFactor); + row.setRaisingFactor(totalBatchWeight / referenceWeight); } protected void prepareBatch(CatchExportRow currentRow, Modified: trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java 2013-07-10 15:47:03 UTC (rev 1134) +++ trunk/tutti-service/src/main/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) @@ -402,7 +402,7 @@ List<GearCaracteristicExportRow> rows = Lists.newArrayList(); - for (Gear gear : cruise.getGear() ) { + for (Gear gear : cruise.getGear()) { Gear gearWithCaracteristics = persistenceService.getGearWithCaracteristics(gear, cruise); exportContext.gearCaracteristicsModel.prepareRows(rows, cruise, gearWithCaracteristics); @@ -554,7 +554,7 @@ catchBatch.getCatchTotalWeight(), catchBatch.getCatchTotalComputedWeight()); - Float totalUnsortedWeight = + float totalUnsortedWeight = catchBatch.getCatchTotalUnsortedComputedWeight(); @@ -574,6 +574,7 @@ Float totalSortedWeight = catchBatch.getCatchTotalSortedComputedWeight(); + //FIXME tchemit 2013-07-12 J'utilise en fait la formule (Poids de la capture totale - poids du HV dans la capture totale) / (poids total capture triée) // (Poids de la capture totale - poids du HV dans la capture totale) / (poids total capture triée - poids du HV dans la capture totale) Float catchRaisingFactor = (totalWeight - totalUnsortedWeight) / totalSortedWeight; @@ -591,7 +592,7 @@ "\nspeciesCatchRaisingFactor : " + speciesCatchRaisingFactor + "\nbenthosCatchRaisingFactor : " + benthosCatchRaisingFactor; - log.debug(message); + log.info(message); } List<CatchExportRow> rows = Lists.newArrayList(); Modified: trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java =================================================================== --- trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-10 15:47:03 UTC (rev 1134) +++ trunk/tutti-service/src/test/java/fr/ifremer/tutti/service/export/TuttiExportService2Test.java 2013-07-12 16:07:22 UTC (rev 1135) @@ -76,13 +76,13 @@ public static final String CATCH_CONTENT = "Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Id_Operation;NumOrdre_Station;Poche;Navire;Taxon;Nom scientifique;Commentaire;VracHorsVrac;Num_Ordre_VracHorsVrac_H2;Tot_VracHorsVrac;Ech_VracHorsVrac;Type_Volume_Poids_VracHorsVrac;Unite_Volume_Poids_VracHorsVrac;Cat_Tri;Num_Ordre_Cat_Tri_H2;Tot_Cat_Tri;Ech_Cat_Tri;Type_Volume_Poids_Cat_Tri;Unite_Volume_Poids_Cat_Tri;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturite;Num_Ordre_Maturite_H2;Tot_Maturite;Ech_Maturite;Type_Volume_Poids_Maturite;Unite_Volume_Poids_Maturite;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Final_Elevation\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;5.4444447;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;5.4444447;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;217.77779;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;217.77779;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;9.074075;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;5.0;1;0.6;cm;1.0;4;0.6;907.4074;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;306;Longueur totale (LT) - individu - totale - Mesure au cm par un observateur;6.0;2;0.4;cm;1.0;10;0.4;1361.1111;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;A;1;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Vrac;1;80.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;80.0;3.5;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;3.5;\n" + - "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;40.0;3.5;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Mâle;1;60.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;60.0;5.8333335;\n" + + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1358;Alosa alosa;;Vrac;2;;;Poids;;NA;;;;;;Femelle;2;40.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;40.0;8.75;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;1938;Agonus cataphractus;;Hors Vrac;1;20.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;20.0;1.0;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;4622;Abietinaria abietina;;Vrac;1;30.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;30.0;7.0;\n" + "2013;test elevation;1;OTB 20/28.10;B;2;1;278970;380;Acanthocardia echinata;;Vrac;2;18.0;;Poids;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;NA;;;;;;;;;;;;;;18.0;7.0;";

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