Hi Tina, We were planning to try to run simulations with -Xmx1000M, but I am not in Nantes at the moment so I have not tried it yet. I will try to run these simulations as soon as I get back and let you know if it worked with -Xmx1000M or not. Loïc Tina ODAKA <Tina.Odaka@ifremer.fr> a écrit :
Hi eric, were you able to see that it use more than 2G of ram?? what about if loic's job is submitted with option like
-Xmx1000M
??
tina
Le 24/12/2013 13:05, Tina Odaka a écrit :
On 24 déc. 2013, at 09:39, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> wrote:
Le 23/12/2013 15:44, Loic GASCHE a écrit :
Bonjour,
A priori le problème de mémoire subsiste.
Si je fais un qstat -f de mon job, j'ai 9 simus qui sont en "expired".
De plus si je fais la commande que m'a donnée Tina, je vois que plusieurs de mes simus de tout à l'heure apparaissent en type 143, avec des quantités de mémoire utilisées supérieures à 2.8 gigas. @Tina: Nous lançons les simulations en limitant la taille de la mémoire à 2Go: /home3/caparmor/poussin/jdk7/bin/java -Djava.library.path=jri64 -DR.type=jni -Xmx2000M -jar isis-fish*.jar
Je ne comprend pas très bien pourquoi le jobs peut prendre jusqu'à 2,8Go. Cela correspond à 2,8Go de mémoire RAM ? ou autre chose est-il compté dans cette mémoire ?
It is ram
When a job is running under your login , if you can find out which compute nosed you are using then do ssh to the compute node And check with top Or ps commands You will see that your java process is using more than 2g of ram ( ssh caparmor Then use command qstat -u your-login To find out your job id currently running qstat -f your-job-id-number to find out which job array number you are running qstat -f your-job-id-number\[array-number\] ( for example qstat -f 123456\[10\] Then you will see r1i1n0 or such host name of compute node ssh r1i1n0 from caparmor)
Tina
-- Éric Chatellier - Code Lutin Tel: 02.40.50.29.28 - http://www.codelutin.com
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