Ah ben non en fait mon csv ne contient de résultats que pour les 13 derniers pas de temps, ce qui expliquerait pourquoi on ne peut pas les voir dans l'interface ISIS. Normalement j'avais supprimé la sauvegarde des 13 derniers pas de temps uniquement. Je remarque que j'ai dans les paramètres avancés une autre option : simulation.store.result.cachestep = 13. Est-ce cette option qui fait que je n'ai une sauvegarde que pour les 13 derniers pas de temps ? Dois-je la supprimer ? Après cela n'explique pas pourquoi je n'ai pas de résultats d'AS ou des valeurs négatives d'abondance ou de biomasse. Loïc Le 03/12/2014 17:29, Loic GASCHE a écrit :
Merci Eric, ça tourne sans cette option.
Par contre :
Je n'ai aucun export des résultats d'AS, même quand ceux-ci sont demandés. Le RData n'est pas mis à jour en fin de simu et ne contient donc que les valeurs prises par les paramètres d'entrée testés.
J'ai bien export des résultats de chaque simu en .csv si ces exports sont demandés, par contre on ne peut pas les visualiser dans l'interface ISIS. On ne peut les voir qu'en allant chercher le .csv.
Il semblerait que ces résultats soient faux car je me retrouve avec des biomasses négatives, mais comme je ne peux pas vérifier autre chose que les csv il est dur de savoir ce qui pose problème. (On n'avait pas déjà eu ce cas de biomasses négatives ?)
Je mets une simu en PJ, il y a "sansExport" dans le nom mais les exports sont bien demandés.
Le 03/12/2014 14:26, Eric Chatellier a écrit :
Le 03/12/2014 11:06, lgasche@ifremer.fr a écrit :
Merci Audric pour la réponse, je vais creuser.
Si un lutin pouvait développer / confirmer... Tu fait bien de relancer, j'avais oublier de traiter ton mail.
Je pense que l'option "-l walltime=10:00:00" ne fonctionne plus à cause d'un changement de configuration de caparmor. Il me répond: "qsub: Job exceeds queue and/or server resource limits"
Mais normalement, avec la nouvelle version d'IsisFish, cette option ne devrait plus servir.
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