Merci beaucoup Sigrid ! Je te dis si j'ai des questions sur le code (et non je veux calibrer sur les captures de toutes les stratégies. je vais changer la ligne 297 : merci !). Camille Le 21 juin 2011 17:45, <Sigrid.Lehuta@ifremer.fr> a écrit :
Camille, voici le script dont tu as besoin (normalement ;-). Tu vas voir je n'ai pas changé grand chose. Essaie de comprendre la difference, sinon demande moi. voici le lien vers l'API des matrices : http://maven-site.nuiton.org/**nuiton-matrix/nuiton-matrix/**apidocs/<http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix/nuiton-matrix/apidocs/> regarde matrixFactory methode create() autre chose: tu ne calibres que sur les captures de certaines strategies (2,3,4,5) (ligne 297), est ce bien ce que tu veux faire ? sinon je t ai mis le bon code en commentaire.
A+
camille de la Vega <cam.delavega@gmail.com> a écrit :
Je vais essayer d'être plus claire.
Dans ISIS, j'ai tous les paramètres qui servent à calculer l'effort de pêche. Je ne peux en modifier aucun exepter la capturabilité.
Les effectifs initiaux utilisés sont ceux de 2001 à 2003 moyennés.
Je veux que ISIS FISH simule des captures (sur 1 an) qui soient égale aux captures observées par le CIEM entre 2001 et 2003. Donc, je donne au simplex le fichier avec les captures moyennes observées sur ces 3 années par classe de taille. Et je voudrais que le simplex ajuste les capturabilités jusqu'à ce que l'effort de pêche soit tel qu' ISIS FISH simule les bonnes valeurs de captures c'est à dire les mêmes valeures que les captures observées entre 2001 et 2003 en moyenne.
Mais en fait je n'ai pas besoin de 55 valeurs de capturabilité différente. Je voudrais avoir 2 valeurs de capturabiltié : une pour les tailles en dessous de 42cm et une pour les tailles au dessus de 42 cm (ce qui représenterait une valeur de capturabilité pour les matures et une pour les immatures). Comme on a des classes de taille de 2cm, group.Id serait 21. Je pensais que c'est ce que faisaient les lignes 367 à 372.
Donc en fait, j'ai une matrice d'une ligne et de 55 colonnes. Avec la ligne qui correspond à une année. Alors que ISIS va me sortir 12 lignes avec 55 colonnes. Avec chaque ligne qui correspond à un mois.
C'est ça le problème ? C'est pour ça que les coordonnées ne sont pas bon après la première simulation ? Du coup il faut faire quoi ? Parce que je n'ai pas les valeurs de captures observées par mois... Si je mets [12,55] alors qu'il n'y a qu'une ligne dans le fichier excel ça va pas marcher...
Le 21 juin 2011 15:26, <Sigrid.Lehuta@ifremer.fr> a écrit :
Alors, mes 55 groupes c'est mes groupe de longueur. J'ai des captures
observées par classes de taille sur 3 années (2001 à 2003) et je veux que le simplex ajuste les capturabilités par classe de taille pour retrouver les mêmes captures quand je simule sur 1 an.
pas sur de comprendre ...
Peut être que dans le fichier csv il faut que je mette les trois années
sans les moyennées directement? Ca me ferai une matrice 3,55.
Tout est possible, y'a que toi qui sait ce que tu veux/dois faire ! quand tu sais, on modifiera le code en consequence.
Le 21 juin 2011 15:05, <Sigrid.Lehuta@ifremer.fr> a écrit :
Salut Camille,
cf les mails récents de Bastien. J imagine que ta matrice de captures observées (ton fichier csv) n'a qu une dimension (captures / groupes?, tu as 55 groupes!!!). Néanmoins ton code java crée une matrice a 2 dimensions [1,55]. (lignes 105-106) Ensuite j imagine que tu as somme ta matrice de debarquements simules comme il faut et qu'elle n a qu une dimension. du coup quand tu boucles sur les deux a la fois les coordonnées de l une ne sont pas compatibles avec celle de l autre.
il faut que tu modifies dans l init la dimension de ta matrice de debarquements observés quand tu la crees.
remarque : j espere que c est pas 55 groupes mais 55 pas de temps car sinon tu ne sommes pas ta matrice de débarquements observés correctement...
Le mieux ca serait que tu expliques exactement, qu est ce que sur quoi tu calibres et sur quoi tu calibres, qu on verifie tout ca.
camille de la Vega <cam.delavega@gmail.com> a écrit :
Merci pour votre réponse.
Donc je dois avoir [1,55] et [0,0]. Mais je ne vois pas dans le
script ou est demandé la coordonnées [0]. Je ne sais pas ou je dois rectifier le code.
Le 21 juin 2011 11:22, Eric Chatellier <chatellier@codelutin.com> a écrit :
Le 21/06/2011 10:13, camille de la Vega a écrit :
> Bonjour, > > > > La simulation avec le plan de simulation "simplex" s'arrète à > simulation_0. > > D'après le debug, il manque quelque chose dans la matrice des > captures > > observées mais je ne sais pas ce que c'est ( le [0] dan la matrice > 1,55 > ). > L'erreur veut dire que l'élément que vous demandez > que la matrice n'est pas demandé avec le bon nombre de dimension. > > matriceDemarquement fait [1, 55] > alors que la coordonnées est [0] > > elle devrait ressembler a [0, 0] > ou matrice dimension devrait n'avoir qu'une seule dimension. > > -- > Éric Chatellier <chatellier@codelutin.com> > Tel: 02.40.50.29.28 > http://www.codelutin.com > > ______________________________******_________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users@list.isis-****fi**sh.org <http://fish.org/><; > Isis-fish-users@list.**isis-**fish.org <http://isis-fish.org/><; > Isis-fish-users@list.**isis-fish.org<Isis-fish-users@list.isis-fish.org>> > > > > > http://list.isis-fish.org/cgi-******bin/mailman/listinfo/isis-******<http://list.isis-fish.org/cgi-****bin/mailman/listinfo/isis-****> > fish-users<http://list.isis-**fish.org/cgi-**bin/mailman/** > listinfo/isis-**fish-users<http://list.isis-fish.org/cgi-**bin/mailman/listinfo/isis-**fish-users> > > > <http://list.isis-**fish.org/**cgi-bin/mailman/**<http://fish.org/cgi-bin/mailman/**> > listinfo/isis-fish-users<http:**//list.isis-fish.org/cgi-bin/** > mailman/listinfo/isis-fish-**users<http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users> > > > > > > > >
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