Bonjour, Ci-dessous les instructions de Mickael pour Datarmor. Il me suggère une solution sans utiliser le SCRATCH. Ci-joint le script .pbs partiellement modifié ; je ne sais pas quelle est la commande pour demander 56 cpus comme indiqué par Mickael. Quelqu'un pourrait-il m'aider ? Merci, Antoine -------- Courriel original -------- Objet: Re: [Ticket#2024031520001384] PBS JOB 8772608.datarmor0 Date: 2024-03-18 11:27 De: Assistance Informatique <assistance@ifremer.fr> À: aricouar <aricouar@ifremer.fr> Dans ce cas on va tenter autre chose. Au lieu de faire du mpi_2, je te propose plutôt de demander 56 cpus et 240gb de ram sur la file omp Tu iras sur un noeud qui a un disque local. Et au lieu d'écrire tes données sous $SCRATCH, essaie de les écrire sous $TMPDIR Tu utiliseras alors le disque local plutôt que le scratch, et l'impact sera alors effacé. -- Mickael DEQUIDT 18.03.2024 10:20 - aricouar a écrit: Da combien faudrait-il réduire le nombre de simulations ? Je peux sans doute réduire un peu mais il me semble important d'en lancer suffisamment en parallèle. Le 2024-03-18 10:05, Assistance Informatique a écrit :
OK.
Peux-tu tout simplement réduire le nombre de simulations en parallèle ? Ou bien l'intérêt du job est-il justement de les paralléliser ?
-- Mickael DEQUIDT
18.03.2024 09:52 - aricouar a écrit: Bonjour,
Non, j'ai lancé un seul job qui comprend 56 simulations en parallèle, mais chacune de ces simulations est assez gourmande en mémoire. Comment pourrais-je faire pour faire tourner ces simulations correctement ? Merci.
Antoine
Le 2024-03-18 09:41, Assistance Informatique a écrit :
Bonjour Antoine,
ah, oui, ton job a dû secouer le scratch suffisamment pour que le serveur PBS le tue direct. Tu en avais lancé plusieurs en même temps ?
-- Mickael DEQUIDT
15.03.2024 16:44 - aricouar a écrit: Bonjour,
Mon job datarmor voir (ci-dessous) a été stoppé. Y a-t-il un problème ? Et cela a-t-il un rapport avec l'extension de mémoire requise ? Merci
Antoine Ricouard
-------- Courriel original -------- Objet: PBS JOB 8772608.datarmor0 Date: 2024-03-15 16:28 De: pcim@ifremer.fr (root) À: aricouar@ifremer.fr
PBS Job Id: 8772608.datarmor0 Job Name: ISIS_MACCO_Eq Job to be deleted at request of root@admin.head.ice.ifremer.fr