November 2007 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

ATTENTION pour les dev isis switch svn/cvs
by Benjamin POUSSIN Nov. 24, 2007

Nov. 24, 2007

Salut, Pour tous les développeurs Isis, ne plus commiter sur le CVS le temps de laisser manu migrer le CVS vers le SVN. Une fois la migration faite il faudra utiliser SVN et plus jamais CVS. J'espere qu'il pourra le faire rapidement (demain vendredi). -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

1 1

Fichier de traduction (le tableau excel de sigrid)
by Benjamin POUSSIN Nov. 22, 2007

Nov. 22, 2007

Salut, Sigrid pourrais-tu envoyer sur la liste le fichier que tu as fait avec les traductions corrigées (le fichier dont tu parlais l'autre soir). ou le mettre dans le suivi de bug de traduction et le dire sur la liste. http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=add&group_id=8&atid=438 merci -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

2 1

Re: [Isis-fish-devel] PermGen space
by Benjamin POUSSIN Nov. 22, 2007

Nov. 22, 2007

On Thu, 22 Nov 2007 11:34:44 +0100 Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> wrote: > Salut Benjamin, > > On peut faire tourner plus de simus avec le nouveau .bat (hibernate...) > (entre 50 et 90 selon les machines) donc ca, CA MARCHE ! > Cependant on est surprises car les simu s arretent tout de meme au bout > d un moment alors qu il n y a pas de pb de place sur le disque : > Precisement cela continue a tourner pendant ~30 simus mais n exporte > plus les resultats dans resultsExport > voici le message contenu dans "information" de l une de ces coquilles > vides ! > > #Simulation Information > #Thu Nov 22 00:25:10 CET 2007 > optimizationUsage= > exception=java.lang.OutOfMemoryError\: PermGen space\r\n > simulationStart=2007.11.22 00\:25\:07 (je précise que je dormais a > cette heure) > > Est ce qu il faut qu on panique ?? non, en fait il faut juste remettre l'option que je vous ai fait enlever, mais cette fois-ci vous pouvez lui alouer moins de memoire et a vous les 200 simulations :) (durant votre sommeil bien sur ;) java -XX:MaxPermSize=128m -Dhibernate.bytecode.provider=javassist ... le 128 est a augmenter si l'erreur persiste -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

1 0

Base Langoustine : too many window handles
by Sigrid LEHUTA Nov. 20, 2007

Nov. 20, 2007

Salut Benjamin et Stephanie, le repis aura ete de courte duree... Les simu de plan d analyse avec la base langoustine ne fonctionnent pas correctement voila ce qu on a : apres 3 simu ca s arrete avec les messages : Exception in thread "SimThread SALangoutineGdGEffMult500 2007-11-19-17-55" fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationException: Out of memory try with more memory (option -mx) et java.lang.OutOfMemoryError: too many window handles On a aussi : ERROR [SimThread SALangoutineGdGEffMult500 2007-11-19-17-55] (TopiaFiresSupport.java:371) fireOnPostRead - Can't fireOnPostRead org.hibernate.LazyInitializationException: could not initialize proxy - the owning Session was closed et encore : WARN [SimThread SALangoutineGdGEffMult500 2007-11-19-17-55] (PopulationGroupImpl.java:102) getMeanWeight - Error in mean weight equation et ni moi ni le check editor ne voyons de quelle erreur il peut s'agir ! Stephanie est ce que ca fonctionne chez toi ? pj : la base, une simu suit dans le prochain mail a+ Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03

1 1

[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 3.0.21
by Benjamin POUSSIN Nov. 8, 2007

Nov. 8, 2007

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-fish-3.0.… pour savoir comment installer et lancer isis-fish http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/Installation.html changelog isis-fish (3.0.21) stable; urgency=high * bug correction in ResultDatastore, bad database used to get result during simulation * add call to close method on SimulationStorage for in memory database * bug correction when launch many simulation with AnalysePlan (OutOfMemory) -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

2 3

Performance V 3.0.20
by Sigrid LEHUTA Nov. 7, 2007

Nov. 7, 2007

Salut Benjamin, J ai installé la V 3.0.20 et j ai synchroniser SiMatrix, Defaut Simulator, RuleUtil - les résultats de simus sont les mêmes :-) - MAIS les performances sont moins bonnes : Je fais tourner des plans de simu ou l on change les parametres dans la base a chaque nouvelle simu et là où je faisais précédemment 25 simus avant "OutOfMemory" je n en fait plus que 10 :'( J ai remis les script SiMatrix, RuleUtil et defaultSimulator précedents (c est bien ca les fichiers ".#SiMatrix.java.1.17" qui apparaissent après synchronisation ?) => ca n y ait rien changé et apparement la V.3.0.19 ne peut pas fonctionner avec le nouveau SiMatrix... les simus plantent Bref je suis un peu perplexe, ce n etait pas vraiment l effet escompté !!! Vois tu pourquoi les performances ont pu diminuer chez moi et pas chez toi ? Y a t il qqch qui peut t aider a m aider !? Au pire comment puis je revenir a la V3.0.19 et reccuperer les scripts precedents ? Merci d avance Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03

2 2

Strategie Non Activité
by Sigrid LEHUTA Nov. 7, 2007

Nov. 7, 2007

Salut Benjamin, Je te transmet une suggestion d'Hilaire : Jusqu ici il est nécessaire de sélectionner au moins une stratégie dans la fenêtre "lancement de simulation" sinon les simus plantent Du coup, nous créons toujours une stratégie "non activité" que l on sélectionne lorsque l on veut simuler sans pêche et qui ne sert a rien d autre On se demande si ça ne serait pas possible de permettre a isis de tourner si aucune stratégie n'est selectionnée (Il s agirait d autoriser l export de matrice resultat de dimension nulle d apres Hilaire) pour eviter de rajouter une strategie. Est ce que c est possible ? merci a tres bientot ;-) Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03

3 3

[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 3.0.20
by Benjamin Poussin Nov. 2, 2007

Nov. 2, 2007

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-fish-3.0.… pour savoir comment installer et lancer isis-fish http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/Installation.html changelog isis-fish (3.0.20) stable; urgency=high * add clean temp directory simulation preparation * add IsisFish version number in parameter * add getPopulations method in PopulationMonitor * bug correction #1592 in totalFishingMortality during reduction of matrix * bug correction #1583 about too many file open * bug in export script template * bug correction in rule Cantonnement * modify database simulation usage, now we use in memory database for data, and file storage for result, to separate result and data. This improve performance (70%). * bug switch to h2 database version 1.0.60, this prevent rollback exception during simulation -- Benjamin -------------------- email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

1 0