October 2020 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

Modification du fonctionnement des simulation sur datarmor
by Eric Chatellier 01 Dec '20

01 Dec '20

Bonjour, Suite à une utilisation non conforme de datarmor par ISIS-Fish, j'ai effectué des modifications pour utiliser le transfert de fichier en FTP au lieu de SSH. La connexion SSH est toujours utilisé pour passer les commandes (qsub...). Serveur FTP ----------- Le service FTP tourne sur eftp.ifremer.fr et on ne peut écrire que dans /scratch (qui correspond à /home1/scratch/user/eftp/). J'ai donc été contraint de tout modifier pour: - uploader les fichiers dans /home1/scratch/user/eftp/ - lancer les simulations à partir des fichiers présent dans /home1/scratch/user/eftp/ - suite à la simulation, écrire les résultats également dans /home1/scratch/user/eftp/ Scratch ------- En me renseignant sur les différents partages "datahome", "datawork" et "scratch", je me suit aperçu que "scratch" était le plus adapté également pour faire tourner les simulations (emplacement du "isis-fish-4"): - accès plus rapide que sur les autres disques (haute performance) - espace de stockage de 10To - pas de sauvegarde - suppression automatique tous les 15 jours Le "HOME" d'ISIS-fish est donc maintenant /home1/scratch/user/isis-fish-4 Il faut noter qu'il est à l'extérieur de /home1/scratch/user/eftp/, donc son contenu n'est pas visible depuis le FTP. Il n'est donc plus possible de connaître la progression d'une simulation, mais je pense que ce n'était très peu utilisé finalement, car au vu du nombre de simulation, lorsque que l'état de la simulation est vérifié, elle est soit non démarrée, soit finie, mais très rarement "en cours". Authentification ---------------- Le login/mot de passe pour le FTP n'est pas le même que celui de datarmor. Il faut utiliser un compte "extranet", à configurer dans ISIS-fish pour s'y connecter. Je continue les tests sur datarmor... -- Éric Chatellier -www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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Test Dynamique de flottille et Datarmor en FTP
by Eric Chatellier 30 Nov '20

30 Nov '20

Bonjour, J'ai préparé une version d'Isis de test (avec isis-fish-4 séparé) qui contient: - la dynamique de flottille - l'utilisation des nœuds FTP pour les transferts de données avec Datarmor Dynamique de flottille ---------------------- Un nouvel onglet est disponible dans les stratégies pour configurer dynamiquement la proportion d'effort des métiers Datarmor -------- Suite à une demande des administrateur de Datarmor, IsisFish doit maintenant utiliser le protocole FTP pour le transferts des données. L'utilisation est la même qu'avant. Seule la configuration change. Il faut maintenant deux login/mot de passe pour utiliser datarmor: - le compte SSH datarmor - le compte Extranet pour le FTP Cette version est téléchargeable ici : https://forge.codelutin.com/attachments/download/6331/isis-fish-4.5.0.0-gaf… Cordialement, -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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nouveaux resultats
by Stephanie MAHEVAS 26 Oct '20

26 Oct '20

Eric, serait-il possible de créer deux nouveaux résultats : matrice de sortie de la fonction de reproduction NbOeufsPondus(zonerepro,t) et la matrice d'entree de recrutement PreRecrus(zonerecru,t) ? Merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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