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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 30 Jun '12

30 Jun '12

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Faire une AS sur les résultats de Janvier ?
by Loic GASCHE 12 Jun '12

12 Jun '12

Bonjour, Je souhaiterais obtenir mes exports et faire mes AS sur le mois de Janvier, et pas sur le mois de Décembre comme cela est fait traditionnellement dans ISIS. Dans les scripts d'export on trouve : TimeStep lastStep = resultStorage.getLastStep(); pour récupérer le dernier pas de temps; mais il n'existe pas de méthode pour récupérer les données sur un autre pas de temps que le dernier. Apparemment on peut imaginer deux façons de procéder : - soit on crée une autre méthode qui permet d'aller chercher directement le pas de temps qui correspond au mois de Janvier de la dernière année (en s'inspirant du code qui est dans le src de getLastStep). Mais est-ce possible de créer une méthode comme cela, et où la créer ? - soit on convertit lastStep (qui apparemment est dans un format TimeStep particulier ?) en un numérique auquel on va soustraire onze mois pour atteindre le mois de Janvier. Mais dans ce cas là comment convertit mon TimeStep en numérique (j'ai bien trouvé un TimeStepConverter dans l'api mais je ne sais pas si c'est ça et comment ça marche) et reconvertir ensuite mon numérique en TimeStep ? Y-a-t-il une autre (meilleure) façon de faire ? Quelle solution semblerait être la plus intéressante ? Merci d'avance ! Loïc

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Gestion de la distribution dans les AS
by Eric Chatellier 07 Jun '12

07 Jun '12

Bonjour, Je vais finir le developpement de la gestion de la distribution dans les AS. L'interface graphique le gère déjà, reste à ajouter le support dans les AS. Jean m'a expliqué un peu comment reprendre la chose. Avant de commencer, je voulais savoir comment doit être gérer la distribution dans les methodes d'AS qui ne le supporte pas : par exemple Morris ? * Morris doit-il toujours tourner en distribution uniforme ? * Ou cela doit-il afficher un message à l'utilisateur ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Rdata qui ne se met pas à jour en fin d'AS ?
by Loic GASCHE 04 Jun '12

04 Jun '12

Bonjour, J'ai fait tourner une AS sur caparmor, après un arrêt étrange du téléchargement des résultats et avoir refait tourner une des simus à la fin (elle ne s'était pas téléchargée ?) j'ai enfin toutes les simulations de mon AS sur mon PC... Le problème est que le Rdata ne s'est pas mis à jour et donc ne contient pas les résultats des simus et les résultats d'AS... Y-a-t-il un moyen pour relancer le processus de création du Rdata à partir des résultats de simulations ? Loïc

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Simu qui ne se lance pas sur Caparmor
by Loic GASCHE 31 May '12

31 May '12

Bonjour, Je voulais faire tourner une grosse AS sur caparmor cette nuit, et ce matin j'ai retrouvé ISIS avec pleins de fenêtres d'erreurs sans texte. Quand je les ai fermées cela a fermé ISIS également, et après l'avoir relancé je me retrouve avec une belle liste de simus en attente... mais rien ne tourne et l'AS n'apparait pas dans la liste des choses entrain de tourner sur caparmor. Le debug ne semble pas indiquer d'erreur, donc je ne pige pas pourquoi ça fait ça... Loïc

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Quid de dataforaov ?
by Loic GASCHE 21 May '12

21 May '12

Bonjour, En voulant faire d'autres anova que celles faites par ISIS à la suite de mes simulations (pour par exemple tester les interactions sans avoir à tout refaire tourner), j'ai observé dans le RData qu'elles sont appelées de la manière suivante par ISIS : aovresult<-aov(SensitivityBiomassRelativeY6_Plaice7D~X1+X2+X3+X4+X5+X6+X7+X8+X9+X10+X11+X12+X13+X14+X15+X16+X17+X18+ X19+X20+X21+X22+X23+X24+X25+X26+X27+X28+X29+X30+X31+X32+X33+X34,data=dataforaov)" La question est d'où sort ce dataforaov ? Et existe-t-il encore dans le RData final ou est-il supprimé à un moment (et remplacé par isis.simule par exemple) ? Loïc

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Impossible de faire une AS sur un niveau de TAC ?
by Loic GASCHE 15 May '12

15 May '12

Bonjour, J'ai profité de la version 4.1.0.1 pour faire tourner diverses AS avec des mesures de gestion. A priori aucun soucis quand on fixe les mesures de gestion et qu'on fait varier d'autres paramètres du modèle. Mais il semble que l'on ne puisse pas faire d'AS sur la valeur de la mesure de gestion elle-même. J'ai par exemple essayé de faire varier la valeur du TAC, et j'obtiens un RData vide et il y a une erreur à la fin du debug. Le pb est que je ne vois pas la cause de cette erreur... Même compressé j'ai un debug trop gros alors j'essaye de le mettre sur http://upload.codelutin.com/. Loïc

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Bug dans l'interface de sélection des règles de gestion
by Loic GASCHE 10 May '12

10 May '12

Bonjour, Je voulais faire des essais d'AS avec des règles de gestion (en particulier TAC, TailleMin) pour essayer de mieux voir où se situe le problème qui faisait stopper mes simulations précédentes. En chargeant une petite AS réalisée avec des TACs pour rajouter la mesure de gestion TailleMin, j'ai observé un bug dans l'interface de saisie des règles de gestion: Je sélectionne ma règle de gestion TailleMin et ses paramètres, et quand je clique sur ajouter rien ne se passe. Et si je clique alors dans la fenêtre règles sélectionnées... Une règle disparait. J'ai essayé en supprimant une règle, en les effaçant toutes et en les remettant, en redémarrant ISIS, et à chaque fois un problème survient. Si j'efface toutes les mesures de gestion et que j'ajoute uniquement une TailleMin, celle-ci n'apparait pas dans la fenêtre "Règles Sélectionnées" mais devient visible si je clique sur cette même fenêtre. A l'inverse quand je supprime cette règle son nom peut rester visible dans la liste. Ce qui est marrant c'est que l'affichage se met à jour si je réduis ISIS et que je le ré-ouvre, donc foncièrement ce n'est pas bloquant. J'ai mis en PJ quelques exemple de ce que j'ai eu. Loïc

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[ANN] - IsisFish 4.1.0.1 released
by forge.codelutin.com Release Notification 10 May '12

10 May '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.0.1 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Use caparmor-sftp instead of caparmor server Issue: 1180. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Impossible de modifier la liste des regles après un rechargement de simulation Issue: 1231. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/files/isis-fish * isis-fish-4.1.0.1-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/384 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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Tester les interactions entre paramètres dans ISIS lors d'un LHS ?
by Loic GASCHE 03 May '12

03 May '12

Bonjour, J'ai fait tourner une AS avec la méthode RandomLHS, et par défaut les interactions entre paramètres ne sont pas testées. Voulant avoir une idée de l'importance de ces interactions, j'ai relancé mon AS en mettant ModifR sur "true" pour pouvoir modifier le code envoyé à R par ISIS et ainsi lui dire de prendre les interactions deux à deux entre paramètres lors de l'anova. Le problème est que le code envoyé n'est que : x<-randomLHS(3500,34) En allant voir la doc du package LHS sur le cran, il semble ne pas y avoir d'autres paramètres à rentrer dans cette méthode qui permettraient de préciser s'il faut tester les interactions ou non. Pourtant c'est Steph qui m'avait dit de faire comme ça, donc je pense que ça a déjà été fait par quelqu'un. Donc si une personne a la solution et peut m'expliquer comment elle a fait pour dire à R de tester les interactions je suis preneur. Loïc

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