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(pas de sujet)
by Sigrid LEHUTA 25 Jun '10

25 Jun '10

et est ce que ca peut etre la nouvelle config pour la queue isis -q isisfish ??? -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)

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Fwd: Re: Crash de java sur caparmor
by Eric Chatellier 25 Jun '10

25 Jun '10

-------- Message original -------- Sujet: Re: Crash de java sur caparmor Date : Fri, 25 Jun 2010 11:39:27 +0200 De : Bernard PREVOSTO <Bernard.Prevosto(a)ifremer.fr> Organisation : IFREMER Pour : Eric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> du côté système il n'y a rien a signaler c'est certainement un problème interne java, mais je ne vois pas trop lequel quand ca se reproduira, pouvez-vous me donner le numéro de quelques jobs pour que je vois si ils ont une similitude entre eux qui m'aiderait a trouver une piste Bernard Eric Chatellier a écrit : > Le 25/06/2010 11:24, Bernard PREVOSTO a écrit : >> Bonjour, > Bonjour, > >> je ne pourrai malheureusement pas vous etre d'un grand secours >> le problème arrive-t-il systématiquement ou non? > En fait, le problème ne se produit que sur caparmor (pour une cause > inconnue) et pas systématiquement. > > Mais, par moment, il se produit trop souvent pour que les utilisateurs > puissent l'utiliser dans de bonnes conditions. > Je l'évaluerais entre 10 et 15%. Sur 3000 simulations, ca représente > un nombre de simulation relativement important à relancer. >> si non, y-a-t-il des différences entre les jobs qui plantent et ceux qui >> marchent? > Non, aucune, les jobs sont tous identiques. > Les plantages sont totalement aléatoires. > > La cause semble plutôt être système que liée aux jobs. > > Merci de votre aide. > -- Bernard PREVOSTO - DOP/DCB/IDM/RIC IFREMER Centre de Brest Tel: 02 98 22 45 43 - Fax: 02 98 22 45 46 Email: Bernard.Prevosto(a)ifremer.fr

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Re: [Isis-fish-devel] Crash de java sur caparmor
by Eric Chatellier 25 Jun '10

25 Jun '10

Le 25/06/2010 11:24, Bernard PREVOSTO a écrit : > Bonjour, Bonjour, > je ne pourrai malheureusement pas vous etre d'un grand secours > le problème arrive-t-il systématiquement ou non? En fait, le problème ne se produit que sur caparmor (pour une cause inconnue) et pas systématiquement. Mais, par moment, il se produit trop souvent pour que les utilisateurs puissent l'utiliser dans de bonnes conditions. Je l'évaluerais entre 10 et 15%. Sur 3000 simulations, ca représente un nombre de simulation relativement important à relancer. > si non, y-a-t-il des différences entre les jobs qui plantent et ceux qui > marchent? Non, aucune, les jobs sont tous identiques. Les plantages sont totalement aléatoires. La cause semble plutôt être système que liée aux jobs. Merci de votre aide. -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Analyse debug
by Benoit Archambault 24 Jun '10

24 Jun '10

Salut tout le monde, est-ce que quelqu'un peux m'expliquer la cause du debug en PJ ? Par exemple en commentant le debug, je pense que c'est loin d'être le premier que je vais avoir (je fais mes premières simulations). Celle là j'ai fait une seule stratégie "test" avec un seul métier sur une seule espèce. En utilisant une stratégie "nulle", le modèle de pop tourne bien J'aimerais apprendre à lire les debugs et situer l'erreur pour pouvoir régler les prochains problèmes par moi même. A priori null pointer donc paramètre non renseigné, reste à savoir où :) Merci benoit

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Re: [Isis-fish-devel] HelpDesk Nv3 / n°63912 : Énormément de crash jvm java sur caparmor (suite)
by Eric Chatellier 03 May '10

03 May '10

On 26/01/2010 16:05, Eric Chatellier wrote: > Le 26/01/2010 15:54, Tina ODAKA a écrit : > Here are some (pbs multijobs) : > - 150652[].service4 (slehuta) : arrayis : 4, 8 > - 150671[].service4 (slehuta) : arrayis : 1, 8, 9, 12, 13 > - 148812[].service4 (slehuta) : > - arrayis : 0, 13, 14, 163, 166, 168, 170, 184, 186, 188, 19, 193, > 195 ... (93 in that job) > - 150470[].service4 (poussin) : arrayis : 16 > - 150373[].service4 (poussin) : arrayis : 10, 30, 47 > - 150481[].service4 (poussin) : arrayid : 5,6 > - 150453[].service4 (poussin) : arrayid : 4, 5, 14, 16 Hi, Is there new information about ticket 63912 ? We are still experiencing too many java JVM crashes :( Regards. -- Éric<chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Conférence ISIS-Fish aux RMLL 2010 à Bordeaux
by Jean Couteau 30 Apr '10

30 Apr '10

Bonjour à tous, je vous annonce que j'animerais une conférence sur ISIS-Fish lors des Rencontres Mondiales du Logiciel Libre 2010 qui se tiendront du 6 au 11 juillet à Bordeaux. Si ça vous intéresse d'y assister... Je n'ai pas encore le jour et l'heure de la conférence, les programmes n'étant pas encore définitifs, mais je vous en ferais part dès que je les aurais. L'annonce de la conférence sur le site des RMLL : http://2010.rmll.info/ISIS-Fish-un-simulateur-libre-pour-la-recherche.html Bonne journée Jean Couteau Code Lutin

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Isis-Fish 3.3.0.3 est disponible
by Eric Chatellier 26 Apr '10

26 Apr '10

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Corrections : * un problème avec l'assistant de création de groupes (non prise en compte de l'age de départ) Améliorations : * ajout de la possibilité de modifier les options qsub (caparmor) Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Isis-Fish 3.3.0.2 est disponible
by Eric Chatellier 07 Apr '10

07 Apr '10

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Cette version corrige : * un problème de migration pour les régions sans carte * un problème de sauvegarde impossible sur une région en cours d'édition * un problème de relancement des simulations locales Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Isis-Fish 3.0.0.1 est disponible
by Eric Chatellier 30 Mar '10

30 Mar '10

Bonjour, Une nouvelle version d'Isis-Fish est disponible au téléchargement à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… Cette version rend configurable l'emplacement de Java pour utiliser un autre serveur de simulation que caparmor. Le changelog complet est disponible à l'adresse : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Éric <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02 40 50 29 28 http://www.codelutin.com

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Session R restant ouverte durant toute la simulation
by Benoit Archambault 29 Mar '10

29 Mar '10

Bonjour, pour le module XSA, j'ai besoin que R se lance lors de l'initialisation , pour l'import des séries temporelles, donc j'ai fait : REngine engine = new RProxy(); dans la methode init,jusque là tout va bien R répond etc Par contre je fais à nouveau appel à R en post action, pour mettre à jour les objets R créés en init, donc il faut que ce soit la même session de R. J'imagine qu'il faut que je lance une session en dehors de la méthode init mais je n'y arrive pas. (et oui toujours limité en java..) En gros pour résumer : R se lance en initialisation , création d'un objet stock dans R. En post action, si c'est le bon mois -> mise à jour du même objet stock dans R. Si quelqu'un a une idée, elle est la bienvenue. Merci, Benoit

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