September 2012 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

script de pre-simulation
by Stephanie MAHEVAS 14 Sep '12

14 Sep '12

Bonjour je voudrais faire un script de presimu qui me change les valeurs de capturabilité. voila le bout de script que j'ai prepare.Mais je ne sais pas comment acceder au simulationStorage et je ne sais pas si la forme/structure est correcte Quelqu'un peut-il jeter un oeil? merci Stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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pb de lancement de simu avec nouveau disque dur
by Stephanie MAHEVAS 13 Sep '12

13 Sep '12

Eric il semblerait que le lancement avec le disque dur externe ne marche pas... tu peux regarder? D'apres Olivier ca pourrait venir du format disque (NTFS-3G) merci steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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script calibration
by Stephanie MAHEVAS 13 Sep '12

13 Sep '12

je voudrais etre sure de ce que ce script fait... Quel partie de ma matrice L2.getSubMatrix(1,2,4).prend ce script???? sachant que les dimensions de L2 = MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP sont /** * Matrix with five dimensions * Dimension 1 : TimeStep * Dimension 2 : Strategy * Dimension 3 : Metier * Dimension 4 : Group * Dimension 5 : Zone */ bout de script dont c'est issu: MatrixND L2 = result.getMatrix(param_Population, ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP); // log.info("dim de L2" + " " + Arrays.toString(L2.getDim())); /////*** If some strategies, metiers or areas must not be included in the cumulated catches see below else put "//" at the beginning of line 297 and replace "L2" by "L" at line 289 /////*** the strategies or so to exclude must be at the begining or end of the list you enter in the parameters interface /////*** fill the line MatrixND L = L2.getSubMatrix(a,b,c).copy(); as follow : /////*** a = 1 if you want to exclude strategies, 2 if metiers and 4 if areas /////*** b = indice of the first object considered /////*** c = number of object to keep after b, b included MatrixND L = L2.getSubMatrix(1,2,4).copy(); Merci steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Re: [Isis-fish-users] Fwd: les simulations ne se rappatrient pas de caparmor
by Eric Chatellier 10 Sep '12

10 Sep '12

Le 10/09/2012 13:42, Olivier BERTHELE a écrit : > Coucou, > > Voilà, Isis est relancé. > Il affiche qu'il est en train de télécharger les résultats... Ok merci. Je vais verifier l'algorithme de controle des simulations en cours pour voir pourquoi il s'arrete seulement pour caparmor. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

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Fwd: les simulations ne se rappatrient pas de caparmor
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 10 Sep '12

10 Sep '12

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plan de simu et caparmor
by Stephanie MAHEVAS 07 Sep '12

07 Sep '12

Eric, il restent deux simulations de caparmor dans le haut de l'interface de la queue de simulation (simulation terminée). Il semblerait que ISIS n'arrive pas à les recuperer. Est-ce que je quitte ISIS et le relance? Les autres sont bel et bien finies et rappatriées pour celles de caparmor. IL n'y a pas photo entre les tps de simu sur Caparmor (15') et sur ceux le serveur (~4h mais surement polué par les dezippages) a+ steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Numéro de simulation pour AS
by Paul MARCHAL 06 Sep '12

06 Sep '12

Bonjour, Je cherche à récupérer le numéro d'une simulation dans une AS. J'ai essayé: context.getSimulationStorage().getParameter().getNumberOfSensitivitySimulation() mais je n'obtiens que le nombre total de simulations. Merci pour vos lumières Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne/mer Boulogne/mer Fishery Resources Laboratory http://wwz.ifremer.fr/manchemerdunord 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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analyses de sensibilité
by Paul MARCHAL 05 Sep '12

05 Sep '12

Bonjour, Je me lance dans une AS pour la première fois et elle me lance d'emblée un message d'erreur (ceci expliquant sans doute cela). Je ne suis pas sûr d'interpréter l'erreur et je vous envoie le debug. Merci pour votre aide Paul -- Paul Marchal IFREMER DOP/DHMMN Laboratoire Ressources Halieutiques de Boulogne/mer Boulogne/mer Fishery Resources Laboratory http://wwz.ifremer.fr/manchemerdunord 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

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plan de simulation
by Stephanie MAHEVAS 04 Sep '12

04 Sep '12

Eric, mon plan de simu ne semble pas marcher, il y a un objet qui n'a pas la bonne dimension... j'ai verifie le fichier qui remplit matrix. Ca ne vient pas de là. est-ce que cela viendrait de mes fichiers slectivityMerlu.txt et slectivityLangoutine.txt et slectivityMerlu.txt ? j'attache le plan et les fichiers necessaires (dans repertoire PlanSelectivite.zip) merci de ton aide steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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[ANN] - IsisFish 4.1.1.1 released
by forge.codelutin.com Release Notification 04 Sep '12

04 Sep '12

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.1.1 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Fix matrix import semantic mapper for PopulationGroup Issue: 1444. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add option to control subprocess allocated memory Issue: 1442. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add option to control caparmor process allocated memory Issue: 1443. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add option to export factor list into mexico xml file Issue: 1450. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Add option to control subprocess max simultaneous process count Issue: 1445. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Memory leak is still present when reading result during export Issue: 1435. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/files * isis-fish-4.1.1.1-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/454 Maven artifacts --------------- Artifacts are deployed in nuiton maven repository http://maven.nuiton.org/other-releases/ Have fun! -IsisFish team

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