July 2019 - Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

MIN TIME BETWEEN TRIP
by Sigrid Lehuta 10 May '22

10 May '22

Bonjour, il semble que "min time between trip" ne soit plus utilisé dans le calcul du nb de marées. Cette equation est dans les sources et je ne sais pas comment y acceder avec le nouveau site. Pouvez vous verifier ? Merci

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Quelques demandes sur ISIS 4.4.2.2
by Audric Vigier 30 Oct '19

30 Oct '19

Bonjour, Je viens de faire un essai sur une analyse de sensibilité, j'ai plusieurs demandes: -est-ce que ce serait possible de rajouter la possibilité de sauvegarder tous les paramètres d'une analyse de sensibilité (dont les facteurs, les résultats et exports à conserver, etc. ... tout ce qui est défini dans l'interface de l'AS), sans être obligé de lancer l'analyse de sensibilité? Ça éviterait de devoir faire tout ce clic-bouton d'une traite. -J'ai renseigné pas mal de choses à travers des pops-ups, soit trop petites soit trop grandes (donc un clic de plus pour changer sa dimension). C'est le cas aussi dans la base de données, pour vérifier si un script compile (la fenêtre est minuscule). Est-ce qu'il y a moyen de revoir la taille de ces fenêtres? -J'ai vraiment galéré pour faire quoi que ce soit avec les équations de migrations aujourd'hui. J'en ai 12 pour le merlu. Dans la base de données, si je veux en modifier une (avec l'éditeur, vérif de compilation, puis bouton Sauver), aucune modif n'est conservée si je ne change pas d'onglet après la sauvegarde (pour modifier les 12 équations, j'ai donc dû jongler 12 fois avec un autre onglet juste pour que les modifs soit bien enregistrées). C'est pareil dans l'interface d'analyse de sensibilité : si je ne changeais pas d'onglet après avoir défini un facteur continu pour équation, l'interface mélangeait tous les facteurs et les équations pour les équations suivantes, et j'étais bon pour tout recommencer depuis le début. -Est-ce que dans une règle de gestion utilisée dans une AS je peux récupérer le numéro de la simulation dans l'analyse de sensibilité, comme on peut le faire avec un plan de simulations? De même, comment y faire référence dans un export de sensibilité? Si je ne peux pas je vais être obligé de me passer de l'interface d'analyse de sensibilité. A+ Audric

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fichiers/dossiers de simu stockés dans AppData\Local\Temp
by Sophie LEFORESTIER 25 Jul '19

25 Jul '19

Re-bonjour Eric, Je me suis aperçue que l'espace sur mon disque C: diminuait à chaque lancement de calibration sur le serveur Datarmor depuis l'interface (sans utiliser calibrar). En effet, des dossiers/fichiers relatifs à chaque simu sont stockés dans "C:\Users\slefores\AppData\Local\Temp" : - un dossier "isisfish-simulation-1545322806149-preparation" par simulation, contenant un dossier "simulators", "data-backup.sql", et le "parameters" de la simu ; - un zip pour chaque simu, contenant toute la définition de la simulation (règles, exports, base...) ; - un fichier ".md5" par simu (ex:sim_calib_etape2_10000combinaisons_2019-07-19-16-43_97026862051049530471432.md5). Puis-je supprimer tous ces documents (sachant que les dossiers de chaque simu en sortie sont stockés sur un disque dur)? Est-ce possible de les enregistrer ailleurs que sur mon disque C:? ou pas du tout s'ils ne sont pas utiles? Merci! Sophie

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lien datahome / datawork
by Sigrid LEHUTA 25 Jul '19

25 Jul '19

Salut Eric, pourrais tu nous donner la marche à suivre pour créer le miroir du isis-fish-4 sur datawork ? A quoi cela sert il ? D'autre part, je ne peux pas ouvrir le isis-fish-4 sur mon datahome, vois tu pourquoi ? je crains que ca ne soit la raison pour laquelle calibrar plante (il ne peut peut etre pas acceder aux resultats ?) Merci -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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erreur ouverture interface ISIS 4.4.2.5
by Sophie LEFORESTIER 23 Jul '19

23 Jul '19

Bonjour, Je ne parviens pas à ouvrir l'interface d'ISIS 4.4.2.5, le message d'erreur ci-dessous apparaît. Une idée de l'origine du problème? Merci Sophie IsisFish a détecté une erreur : 0 java.lang.ArrayIndexOutOfBoundsException: 0 at java.beans.XMLDecoder.readObject(Unknown Source) at org.nuiton.widget.SwingSession.loadStates(SwingSession.java:228) at org.nuiton.widget.SwingSession. (SwingSession.java:124) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.lambda$launchUI$1(IsisFish.java:710) at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$500(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source)

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getN()
by Baptiste ALGLAVE 23 Jul '19

23 Jul '19

Bonjour, je me demandais quelle est la matrice que renvoie la fonction getN() : la matrice AbundanceBeginMonth ou bien la matrice Abundance ? Merci, Baptiste.

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équation d'inactivité - rôle des espaces
by Sophie LEFORESTIER 19 Jul '19

19 Jul '19

Bonjour, J'ai modifié une équation d'inactivité dans l'interface d'ISIS (ci-dessous) et je me suis rendue compte qu'ISIS ne tenait pas compte de cette nouvelle équation. Ce n'est qu'après avoir supprimé les espaces qui suivent chaque virgule que ça a fonctionné. Les espaces au sein des équations ont-ils vraiment une influence? double inac[] = {23.2, 21.85, 23.13, 24.5, 26.66, 23.65, 24.21, 23.1, 23.56, 25.29, 24.36, 25.55}; return inac[month.getMonthNumber()]; Merci! Sophie

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erreur en lancant une calibration Calibrar sur datarmor
by Sigrid LEHUTA 18 Jul '19

18 Jul '19

Hello j ai cette erreur en lancant une calib sur datarmor avec la V4.4.2.5. Merci ! Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/nuiton/math/matrix/SemanticMapper at java.lang.Class.getDeclaredMethods0(Native Method) at java.lang.Class.privateGetDeclaredMethods(Class.java:2701) at java.lang.Class.privateGetMethodRecursive(Class.java:3048) at java.lang.Class.getMethod0(Class.java:3018) at java.lang.Class.getMethod(Class.java:1784) at sun.launcher.LauncherHelper.validateMainClass(LauncherHelper.java:544) at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:526) Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.nuiton.math.matrix.SemanticMapper at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:381) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424) at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:331) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357) ... 7 more -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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ou est le isis-config ?
by Sigrid LEHUTA 17 Jul '19

17 Jul '19

Bonjour, j'ai besoin de modifier le chemin vers isis-fish-4 sans ouvrir ISIS (disque non accessible). Je sais qu'il est possible de mofifier le fichier isis-config mais je ne le trouve pas. Pourriez vous m indiquer son emplacement ? D'autre part, je pensais que qd le disque renseigné dans la config n est pas accessible, isis installe par defaut le isis-fish-4 dans user/... Ca permet au moins qu il s ouvre... Merci -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Archive list users
by Sigrid LEHUTA 17 Jul '19

17 Jul '19

Hello, il me semble que l on pouvait faire une recherche dans les archives de la liste users. Je n ai pas trouvé comment faire sur cette page : http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/ Merci -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER Nantes Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105, 44311 Nantes Cedex 03, France Tél : 02 40 37 42 38 (N° interne : 8238) Membre de l'Association Française d'Halieutique https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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