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Pas de résultats dans l'AS
by Bastien Preuss 14 Mar '12

14 Mar '12

Bonjour, Jai toujours un soucis avec les résultats de mes AS. Parfois tout se passe bien, mais régulièrement soit les dossiers de résultats sont vides, soit il y a des NA dans les valeurs dindices (se sont des AS avec Morris). Comme mes plans dexpérience prennent 2 jours, cest assez embêtant de se retrouver avec des résultats vides après autant de temps de simu. Pendant les simu tout semble se passer correctement, elles sont toutes terminées, et je ne vois pas derreur dans le log. Par contre quand je fais « analyse des résultats », ce génére lerreur suivante dans le debug (dans le cas dun résultat vide) : ERROR [AWT-EventQueue-0] (AbstractSensitivityCalculator.java:322) createImportInstruction - An error occured trying to read a result file : C:\Documents and Settings\Administrateur\isis-database-3\simulations\as_Test_Morris_Bec_2a_1s eulMortNat_MigJanv_2012-03-13-16-32_18\resultExports\SensitivityCapturesWeig htY1.csv (Le chemin d'accès spécifié est introuvable) ERROR [AWT-EventQueue-0] (SimulAction.java:1095) runSensitivitySecondPass - Can't call analyse result fr.ifremer.isisfish.simulator.sensitivity.SensitivityException: Can't evaluate results Quand je vais voir se fichier qui correspond à la 18eme simulation du plan, il est effectivement vide contrairement à ceux de simu précédente. De plus, les fichiers dexport des résultats dans le dossiers « sensitivityresults » sont absent et le R.data ne fait apparaitre aucun objet quand je le charge dans R. Du coup, je ne comprends pas trop doù vient le problème. Je mets le Debug en PJ. Merci davanc epour votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] pb affichage fenetre paramètre AS
by Bastien Preuss 14 Mar '12

14 Mar '12

Bonjour, Pour le pb daffichage de fenêtre blanche, il sagit bien dune incompatibilité avec Windows 7. Le problème vient du dimensionnement des fenêtres. Ça fonctionne lorsque la fenêtre est petite et ça ne fonctionne pas lorsque la fenêtre est grande. En effet, je ne sais pas pourquoi, mais certaines fenêtres ont une taille qui rentre dans lécran, et dautre (cest le cas pour léquation de repro et les taux de migration) sont plus grandes que lécran. Sous XP ça nest pas très pratique mais on sen sort, alors que sous W7 la fenêtre est blanche. Il suffit parfois de la redimensionner pour faire apparaitre le contenu. Si non une façon plus radicale que jai trouvé est de lancer Isis en mode XP, en faisant clic droit sur le .bat, propriété, compatibilité, exécuter ce programme en mode de compatibilité, et là choisir XP. Voilà Je suis par contre toujours preneur de solutions concernant les résultats vides ou NA dans les AS ! Bonne journée. Bastien De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Bastien Preuss Envoyé : mercredi 14 mars 2012 11:38 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : [Isis-fish-users] pb affichage fenetre paramètre AS Bonjour, Je rencontre un autre problème lors de mes AS. Dans longlet Analyse de sensibilité, lors de la sélection des paramètres et des intervalles de variation, jai un problème daffichage. Pour léquation de reproduction et pour les taux de migration, la fenêtre qui souvre pour choisir le paramètre est vide, tout est blanc ! Je ne peux donc pas intégrer ces paramètres à mes AS Pour les autres paramètres ça fonctionne correctement. Quest ce qui pourrait provoquer ce pb ? Cet ordi est sous W7 32 bits y a-t-il des problèmes de ce genre connus ? Je mets le debug en PJ au cas où, mais je nai rien vu de particulier dedans. Merci de votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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pb affichage fenetre paramètre AS
by Bastien Preuss 14 Mar '12

14 Mar '12

Bonjour, Je rencontre un autre problème lors de mes AS. Dans longlet Analyse de sensibilité, lors de la sélection des paramètres et des intervalles de variation, jai un problème daffichage. Pour léquation de reproduction et pour les taux de migration, la fenêtre qui souvre pour choisir le paramètre est vide, tout est blanc ! Je ne peux donc pas intégrer ces paramètres à mes AS Pour les autres paramètres ça fonctionne correctement. Quest ce qui pourrait provoquer ce pb ? Cet ordi est sous W7 32 bits y a-t-il des problèmes de ce genre connus ? Je mets le debug en PJ au cas où, mais je nai rien vu de particulier dedans. Merci de votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Pas de résultats dans l'AS
by Bastien Preuss 13 Mar '12

13 Mar '12

Toujours pour le même soucis, je viens de remarquer quelque chose détonnant : Après mon AS où les résultats sont vides (mail précédent), jai fermé Isis, puis je lai rouvert, et jai relancé une nouvelle AS, et là apparait en tête de la liste des simulations en cours, la simulation n°18 de mon AS précédente !! Il sagit effectivement de la simu spécifiée dans le message derreur du mail précédent, mais elle apparaissait pourtant comme terminée avant que je ferme Isis. Par contre là elle ne tourne pas, rien nest indiqué dans la colonne « Etat », se sont mes autres simu de la nouvelle AS qui tournent. Là je ne comprends pas très bien pourquoi Isis fait cela ? Ce genre de pb a-t-il déjà été rencontré ? Y a-t-il des raisons a priori ? Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

C'est bon ça fonctionne !! Merci. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 23:41 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 13:37, bastien preuss a écrit : > Effectivement, > > Du coup je remets comme avant ?: > > "C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2\bin" Oui. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Pas de résultat dans le .Rdata
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Bonjour, jai un autre problème, lorsque que je fais une AS sur lune de mes espèces, les simu tournent, mais après, mes résultats sont vides rien dans le R.data et pas de fichiers .csv dans le dossier de la simu. Jai vérifié, et jai bien sélectionné les exports dans la fenêtre dAS. Jai fait une AS avec une autre espèce et tout a fonctionné correctement, et dans le débug, je ne vois pas doù vient lerreur. Je mets le debug en pièce jointe. Merci davance. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

ça y est isis démarre, c'était un pb de guillemets autour du chemin d'accès. Donc maintenant quand je lance l'AS, ça plante toujours, mais il n'y a plus mention du pb 32-64 bits, mais seulement la ligne suivante (je mets aussi le debug en PJ): Cannot find JRI native library! Please make sure that the JRI native library is in a directory listed in java.library.path. java.lang.UnsatisfiedLinkError: C:\Documents and Settings\bpreuss\Desktop\isis-fish-3.3.0.9\jri\jri.dll: Can't find dependent libraries -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:45 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:41, Bastien Preuss a écrit : > Isis ne s'ouvre plus même en rajoutant \bin ... > Que contient le debug.txt dans ce cas ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Isis ne s'ouvre plus même en rajoutant \bin ... -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:37 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:33, Bastien Preuss a écrit : > Je remplace uniquement le "java" au début de la dernière ligne? > Ou toutes les fois où "java" apparait? Au debut de la dernier ligne. > Parce que là Isis ne démarre m^me plus ! A verifier que le chemin est bon. J'ai oublier le \bin je pense: C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\bin\java -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Voici le contenu de mon isifish.bat @echo off echo [Script] Isis starting... C:\Program Files (x86)\Java\jdk1.6.0_24\java -Xmx1024M -Djava.library.path=jri -DR.type=jni -jar isis-fish-3.3.0.9.jar %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > debug.txt 2>&1 -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits
by Bastien Preuss 12 Mar '12

12 Mar '12

Je remplace uniquement le "java" au début de la dernière ligne? Ou toutes les fois où "java" apparait? Parce que là Isis ne démarre m^me plus ! -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : lundi 12 mars 2012 22:24 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] pb 32-64 bits Le 12/03/2012 12:19, Bastien Preuss a écrit : > Je rencontre toujours le pb sur ma machine avec 32 et 64 bits. > Pour récapituler : > > J'ai dans le path : %R_HOME%\bin\i386; %JAVA_HOME%\bin > Dans la variable R_HOME : C:\Progam Files(x86)\R\R-2.9.2 > Dans la variable JAVA_HOME : C:\Program Files(x86)\Java\jrk1.6.0_24 Ca m'a l'air bon. Il est possible qu'il y ait un autre Java sur le PC pour qu'il en trouve un autre dans ce cas. Sinon, une autre solution, dans le fichier isisfish.bat tu peux remplacer "java" par: "C:\Program Files(x86)\Java\jdk1.6.0_24\java" il n'y aura plus de doute. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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